Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3T1

4933436I01Rik, RIKEN cDNA 4933436I01, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933436I01RikQ9D3T1 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4933436I01RikQ9D3T1 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4933436I01RikQ9D3T1 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4933436I01RikQ9D3T1 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4933436I01RikQ9D3T1 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4933436I01RikQ9D3T1 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4933436I01RikQ9D3T1 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4933436I01RikQ9D3T1 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4933436I01RikQ9D3T1 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4933436I01RikQ9D3T1 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
4933436I01RikQ9D3T1 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4933436I01RikQ9D3T1 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4933436I01RikQ9D3T1 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4933436I01RikQ9D3T1 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4933436I01RikQ9D3T1 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4933436I01RikQ9D3T1 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4933436I01RikQ9D3T1 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4933436I01RikQ9D3T1 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4933436I01RikQ9D3T1 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4933436I01RikQ9D3T1 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4933436I01RikQ9D3T1 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4933436I01RikQ9D3T1 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4933436I01RikQ9D3T1 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4933436I01RikQ9D3T1 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4933436I01RikQ9D3T1 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4933436I01RikQ9D3T1 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4933436I01RikQ9D3T1 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933436I01RikQ9D3T1 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
4933436I01RikQ9D3T1 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933436I01RikQ9D3T1 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933436I01RikQ9D3T1 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933436I01RikQ9D3T1 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933436I01RikQ9D3T1 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933436I01RikQ9D3T1 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933436I01RikQ9D3T1 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
4933436I01RikQ9D3T1 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933436I01RikQ9D3T1 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933436I01RikQ9D3T1 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933436I01RikQ9D3T1 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933436I01RikQ9D3T1 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933436I01RikQ9D3T1 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933436I01RikQ9D3T1 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933436I01RikQ9D3T1 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933436I01RikQ9D3T1 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933436I01RikQ9D3T1 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933436I01RikQ9D3T1 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933436I01RikQ9D3T1 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933436I01RikQ9D3T1 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933436I01RikQ9D3T1 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933436I01RikQ9D3T1 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4933436I01RikQ9D3T1 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4933436I01RikQ9D3T1 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4933436I01RikQ9D3T1 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4933436I01RikQ9D3T1 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4933436I01RikQ9D3T1 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4933436I01RikQ9D3T1 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4933436I01RikQ9D3T1 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4933436I01RikQ9D3T1 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4933436I01RikQ9D3T1 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4933436I01RikQ9D3T1 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4933436I01RikQ9D3T1 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4933436I01RikQ9D3T1 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4933436I01RikQ9D3T1 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4933436I01RikQ9D3T1 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4933436I01RikQ9D3T1 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4933436I01RikQ9D3T1 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4933436I01RikQ9D3T1 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4933436I01RikQ9D3T1 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4933436I01RikQ9D3T1 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
4933436I01RikQ9D3T1 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4933436I01RikQ9D3T1 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4933436I01RikQ9D3T1 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
4933436I01RikQ9D3T1 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4933436I01RikQ9D3T1 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
4933436I01RikQ9D3T1 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4933436I01RikQ9D3T1 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4933436I01RikQ9D3T1 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
4933436I01RikQ9D3T1 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4933436I01RikQ9D3T1 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4933436I01RikQ9D3T1 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
4933436I01RikQ9D3T1 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4933436I01RikQ9D3T1 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4933436I01RikQ9D3T1 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4933436I01RikQ9D3T1 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4933436I01RikQ9D3T1 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4933436I01RikQ9D3T1 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4933436I01RikQ9D3T1 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
4933436I01RikQ9D3T1 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4933436I01RikQ9D3T1 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
4933436I01RikQ9D3T1 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
4933436I01RikQ9D3T1 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4933436I01RikQ9D3T1 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4933436I01RikQ9D3T1 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
4933436I01RikQ9D3T1 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
4933436I01RikQ9D3T1 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
4933436I01RikQ9D3T1 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4933436I01RikQ9D3T1 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
4933436I01RikQ9D3T1 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4933436I01RikQ9D3T1 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4933436I01RikQ9D3T1 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms