Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx29Q9D3S3 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx29Q9D3S3 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx29Q9D3S3 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx29Q9D3S3 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx29Q9D3S3 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx29Q9D3S3 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx29Q9D3S3 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx29Q9D3S3 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx29Q9D3S3 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx29Q9D3S3 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx29Q9D3S3 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx29Q9D3S3 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx29Q9D3S3 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx29Q9D3S3 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx29Q9D3S3 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx29Q9D3S3 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx29Q9D3S3 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx29Q9D3S3 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx29Q9D3S3 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx29Q9D3S3 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx29Q9D3S3 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx29Q9D3S3 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx29Q9D3S3 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx29Q9D3S3 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx29Q9D3S3 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx29Q9D3S3 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx29Q9D3S3 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx29Q9D3S3 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx29Q9D3S3 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx29Q9D3S3 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx29Q9D3S3 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx29Q9D3S3 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx29Q9D3S3 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx29Q9D3S3 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx29Q9D3S3 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx29Q9D3S3 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx29Q9D3S3 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx29Q9D3S3 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx29Q9D3S3 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx29Q9D3S3 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx29Q9D3S3 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx29Q9D3S3 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx29Q9D3S3 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx29Q9D3S3 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx29Q9D3S3 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx29Q9D3S3 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx29Q9D3S3 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx29Q9D3S3 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx29Q9D3S3 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx29Q9D3S3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snx29Q9D3S3 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snx29Q9D3S3 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snx29Q9D3S3 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snx29Q9D3S3 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snx29Q9D3S3 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snx29Q9D3S3 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snx29Q9D3S3 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snx29Q9D3S3 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snx29Q9D3S3 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snx29Q9D3S3 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Snx29Q9D3S3 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snx29Q9D3S3 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Snx29Q9D3S3 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snx29Q9D3S3 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snx29Q9D3S3 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snx29Q9D3S3 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snx29Q9D3S3 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snx29Q9D3S3 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snx29Q9D3S3 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snx29Q9D3S3 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snx29Q9D3S3 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snx29Q9D3S3 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snx29Q9D3S3 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snx29Q9D3S3 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snx29Q9D3S3 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snx29Q9D3S3 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snx29Q9D3S3 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snx29Q9D3S3 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snx29Q9D3S3 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snx29Q9D3S3 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snx29Q9D3S3 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snx29Q9D3S3 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snx29Q9D3S3 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snx29Q9D3S3 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snx29Q9D3S3 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snx29Q9D3S3 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snx29Q9D3S3 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snx29Q9D3S3 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snx29Q9D3S3 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snx29Q9D3S3 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snx29Q9D3S3 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snx29Q9D3S3 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snx29Q9D3S3 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snx29Q9D3S3 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snx29Q9D3S3 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snx29Q9D3S3 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snx29Q9D3S3 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snx29Q9D3S3 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Snx29Q9D3S3 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms