Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3R6

Katnal2, Katanin p60 ATPase-containing subunit A-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Katnal2Q9D3R6 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Katnal2Q9D3R6 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Katnal2Q9D3R6 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Katnal2Q9D3R6 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Katnal2Q9D3R6 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Katnal2Q9D3R6 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Katnal2Q9D3R6 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Katnal2Q9D3R6 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Katnal2Q9D3R6 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Katnal2Q9D3R6 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Katnal2Q9D3R6 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Katnal2Q9D3R6 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Katnal2Q9D3R6 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Katnal2Q9D3R6 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Katnal2Q9D3R6 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Katnal2Q9D3R6 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Katnal2Q9D3R6 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Katnal2Q9D3R6 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Katnal2Q9D3R6 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Katnal2Q9D3R6 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Katnal2Q9D3R6 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Katnal2Q9D3R6 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Katnal2Q9D3R6 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Katnal2Q9D3R6 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Katnal2Q9D3R6 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Katnal2Q9D3R6 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Katnal2Q9D3R6 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Katnal2Q9D3R6 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Katnal2Q9D3R6 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Katnal2Q9D3R6 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Katnal2Q9D3R6 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Katnal2Q9D3R6 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Katnal2Q9D3R6 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Katnal2Q9D3R6 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Katnal2Q9D3R6 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Katnal2Q9D3R6 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Katnal2Q9D3R6 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Katnal2Q9D3R6 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Katnal2Q9D3R6 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Katnal2Q9D3R6 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Katnal2Q9D3R6 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Katnal2Q9D3R6 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Katnal2Q9D3R6 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Katnal2Q9D3R6 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Katnal2Q9D3R6 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Katnal2Q9D3R6 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Katnal2Q9D3R6 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Katnal2Q9D3R6 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Katnal2Q9D3R6 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Katnal2Q9D3R6 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Katnal2Q9D3R6 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Katnal2Q9D3R6 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Katnal2Q9D3R6 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Katnal2Q9D3R6 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Katnal2Q9D3R6 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Katnal2Q9D3R6 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Katnal2Q9D3R6 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Katnal2Q9D3R6 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Katnal2Q9D3R6 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Katnal2Q9D3R6 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Katnal2Q9D3R6 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Katnal2Q9D3R6 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Katnal2Q9D3R6 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Katnal2Q9D3R6 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Katnal2Q9D3R6 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Katnal2Q9D3R6 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Katnal2Q9D3R6 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Katnal2Q9D3R6 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Katnal2Q9D3R6 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Katnal2Q9D3R6 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Katnal2Q9D3R6 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Katnal2Q9D3R6 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Katnal2Q9D3R6 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Katnal2Q9D3R6 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Katnal2Q9D3R6 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Katnal2Q9D3R6 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Katnal2Q9D3R6 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Katnal2Q9D3R6 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Katnal2Q9D3R6 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Katnal2Q9D3R6 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Katnal2Q9D3R6 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Katnal2Q9D3R6 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Katnal2Q9D3R6 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Katnal2Q9D3R6 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Katnal2Q9D3R6 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Katnal2Q9D3R6 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Katnal2Q9D3R6 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Katnal2Q9D3R6 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Katnal2Q9D3R6 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Katnal2Q9D3R6 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Katnal2Q9D3R6 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Katnal2Q9D3R6 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Katnal2Q9D3R6 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Katnal2Q9D3R6 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Katnal2Q9D3R6 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Katnal2Q9D3R6 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Katnal2Q9D3R6 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Katnal2Q9D3R6 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Katnal2Q9D3R6 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Katnal2Q9D3R6 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms