Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rufy3Q9D394 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rufy3Q9D394 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rufy3Q9D394 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rufy3Q9D394 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rufy3Q9D394 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rufy3Q9D394 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rufy3Q9D394 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rufy3Q9D394 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rufy3Q9D394 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Rufy3Q9D394 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rufy3Q9D394 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rufy3Q9D394 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rufy3Q9D394 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rufy3Q9D394 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rufy3Q9D394 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rufy3Q9D394 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rufy3Q9D394 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rufy3Q9D394 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rufy3Q9D394 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rufy3Q9D394 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rufy3Q9D394 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rufy3Q9D394 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rufy3Q9D394 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rufy3Q9D394 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Rufy3Q9D394 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rufy3Q9D394 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rufy3Q9D394 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rufy3Q9D394 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rufy3Q9D394 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rufy3Q9D394 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rufy3Q9D394 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rufy3Q9D394 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rufy3Q9D394 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rufy3Q9D394 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rufy3Q9D394 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rufy3Q9D394 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Rufy3Q9D394 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rufy3Q9D394 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rufy3Q9D394 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rufy3Q9D394 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rufy3Q9D394 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rufy3Q9D394 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rufy3Q9D394 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rufy3Q9D394 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rufy3Q9D394 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rufy3Q9D394 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rufy3Q9D394 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rufy3Q9D394 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rufy3Q9D394 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rufy3Q9D394 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rufy3Q9D394 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rufy3Q9D394 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rufy3Q9D394 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rufy3Q9D394 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rufy3Q9D394 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rufy3Q9D394 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rufy3Q9D394 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rufy3Q9D394 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rufy3Q9D394 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rufy3Q9D394 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rufy3Q9D394 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rufy3Q9D394 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rufy3Q9D394 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rufy3Q9D394 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rufy3Q9D394 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rufy3Q9D394 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rufy3Q9D394 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rufy3Q9D394 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rufy3Q9D394 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rufy3Q9D394 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rufy3Q9D394 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rufy3Q9D394 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rufy3Q9D394 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rufy3Q9D394 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rufy3Q9D394 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rufy3Q9D394 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rufy3Q9D394 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rufy3Q9D394 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rufy3Q9D394 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rufy3Q9D394 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rufy3Q9D394 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rufy3Q9D394 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rufy3Q9D394 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rufy3Q9D394 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Rufy3Q9D394 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rufy3Q9D394 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rufy3Q9D394 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rufy3Q9D394 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rufy3Q9D394 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rufy3Q9D394 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rufy3Q9D394 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rufy3Q9D394 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rufy3Q9D394 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rufy3Q9D394 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rufy3Q9D394 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rufy3Q9D394 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rufy3Q9D394 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rufy3Q9D394 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rufy3Q9D394 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms