Protein–RNA interactions for Protein: Q9D384

Snrnp35, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 35 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp35Q9D384 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snrnp35Q9D384 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snrnp35Q9D384 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snrnp35Q9D384 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Snrnp35Q9D384 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snrnp35Q9D384 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snrnp35Q9D384 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snrnp35Q9D384 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snrnp35Q9D384 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snrnp35Q9D384 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snrnp35Q9D384 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snrnp35Q9D384 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snrnp35Q9D384 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snrnp35Q9D384 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snrnp35Q9D384 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snrnp35Q9D384 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snrnp35Q9D384 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snrnp35Q9D384 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snrnp35Q9D384 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snrnp35Q9D384 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snrnp35Q9D384 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snrnp35Q9D384 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snrnp35Q9D384 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snrnp35Q9D384 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snrnp35Q9D384 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snrnp35Q9D384 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snrnp35Q9D384 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snrnp35Q9D384 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snrnp35Q9D384 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snrnp35Q9D384 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snrnp35Q9D384 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snrnp35Q9D384 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snrnp35Q9D384 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snrnp35Q9D384 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snrnp35Q9D384 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snrnp35Q9D384 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Snrnp35Q9D384 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snrnp35Q9D384 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snrnp35Q9D384 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snrnp35Q9D384 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snrnp35Q9D384 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snrnp35Q9D384 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snrnp35Q9D384 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snrnp35Q9D384 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snrnp35Q9D384 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snrnp35Q9D384 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snrnp35Q9D384 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snrnp35Q9D384 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snrnp35Q9D384 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snrnp35Q9D384 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snrnp35Q9D384 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snrnp35Q9D384 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snrnp35Q9D384 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snrnp35Q9D384 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Snrnp35Q9D384 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snrnp35Q9D384 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snrnp35Q9D384 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snrnp35Q9D384 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snrnp35Q9D384 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snrnp35Q9D384 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snrnp35Q9D384 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snrnp35Q9D384 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snrnp35Q9D384 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snrnp35Q9D384 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snrnp35Q9D384 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snrnp35Q9D384 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snrnp35Q9D384 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snrnp35Q9D384 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snrnp35Q9D384 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snrnp35Q9D384 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snrnp35Q9D384 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snrnp35Q9D384 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Snrnp35Q9D384 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snrnp35Q9D384 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snrnp35Q9D384 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snrnp35Q9D384 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snrnp35Q9D384 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snrnp35Q9D384 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snrnp35Q9D384 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snrnp35Q9D384 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snrnp35Q9D384 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snrnp35Q9D384 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snrnp35Q9D384 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snrnp35Q9D384 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snrnp35Q9D384 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snrnp35Q9D384 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snrnp35Q9D384 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snrnp35Q9D384 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snrnp35Q9D384 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snrnp35Q9D384 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snrnp35Q9D384 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snrnp35Q9D384 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snrnp35Q9D384 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snrnp35Q9D384 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snrnp35Q9D384 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snrnp35Q9D384 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Snrnp35Q9D384 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snrnp35Q9D384 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Snrnp35Q9D384 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snrnp35Q9D384 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms