Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Y5

Snx20, Sorting nexin-20, mousemouse

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Length 313 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx20Q9D2Y5 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx20Q9D2Y5 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx20Q9D2Y5 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx20Q9D2Y5 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx20Q9D2Y5 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx20Q9D2Y5 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx20Q9D2Y5 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx20Q9D2Y5 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx20Q9D2Y5 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx20Q9D2Y5 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx20Q9D2Y5 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx20Q9D2Y5 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx20Q9D2Y5 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx20Q9D2Y5 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx20Q9D2Y5 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx20Q9D2Y5 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx20Q9D2Y5 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx20Q9D2Y5 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx20Q9D2Y5 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx20Q9D2Y5 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx20Q9D2Y5 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx20Q9D2Y5 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx20Q9D2Y5 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx20Q9D2Y5 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx20Q9D2Y5 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx20Q9D2Y5 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx20Q9D2Y5 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Snx20Q9D2Y5 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Snx20Q9D2Y5 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx20Q9D2Y5 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Snx20Q9D2Y5 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Snx20Q9D2Y5 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Snx20Q9D2Y5 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx20Q9D2Y5 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx20Q9D2Y5 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx20Q9D2Y5 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx20Q9D2Y5 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Snx20Q9D2Y5 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Snx20Q9D2Y5 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Snx20Q9D2Y5 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Snx20Q9D2Y5 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx20Q9D2Y5 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx20Q9D2Y5 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx20Q9D2Y5 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx20Q9D2Y5 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx20Q9D2Y5 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Snx20Q9D2Y5 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx20Q9D2Y5 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx20Q9D2Y5 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx20Q9D2Y5 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx20Q9D2Y5 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx20Q9D2Y5 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Snx20Q9D2Y5 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx20Q9D2Y5 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx20Q9D2Y5 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx20Q9D2Y5 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx20Q9D2Y5 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx20Q9D2Y5 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx20Q9D2Y5 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx20Q9D2Y5 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx20Q9D2Y5 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx20Q9D2Y5 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx20Q9D2Y5 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx20Q9D2Y5 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx20Q9D2Y5 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx20Q9D2Y5 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx20Q9D2Y5 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx20Q9D2Y5 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx20Q9D2Y5 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx20Q9D2Y5 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx20Q9D2Y5 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx20Q9D2Y5 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx20Q9D2Y5 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx20Q9D2Y5 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx20Q9D2Y5 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx20Q9D2Y5 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx20Q9D2Y5 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx20Q9D2Y5 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx20Q9D2Y5 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx20Q9D2Y5 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms