Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H8

Fndc8, Fibronectin type III domain-containing protein 8, mousemouse

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Length 321 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc8Q9D2H8 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fndc8Q9D2H8 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fndc8Q9D2H8 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fndc8Q9D2H8 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fndc8Q9D2H8 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fndc8Q9D2H8 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Fndc8Q9D2H8 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fndc8Q9D2H8 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fndc8Q9D2H8 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fndc8Q9D2H8 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fndc8Q9D2H8 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Fndc8Q9D2H8 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fndc8Q9D2H8 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fndc8Q9D2H8 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fndc8Q9D2H8 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fndc8Q9D2H8 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fndc8Q9D2H8 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fndc8Q9D2H8 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fndc8Q9D2H8 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fndc8Q9D2H8 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fndc8Q9D2H8 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fndc8Q9D2H8 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fndc8Q9D2H8 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fndc8Q9D2H8 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fndc8Q9D2H8 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fndc8Q9D2H8 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fndc8Q9D2H8 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fndc8Q9D2H8 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fndc8Q9D2H8 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fndc8Q9D2H8 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fndc8Q9D2H8 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fndc8Q9D2H8 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fndc8Q9D2H8 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fndc8Q9D2H8 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fndc8Q9D2H8 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fndc8Q9D2H8 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Fndc8Q9D2H8 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fndc8Q9D2H8 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Fndc8Q9D2H8 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Fndc8Q9D2H8 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
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Fndc8Q9D2H8 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
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Fndc8Q9D2H8 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fndc8Q9D2H8 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Fndc8Q9D2H8 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Fndc8Q9D2H8 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fndc8Q9D2H8 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Fndc8Q9D2H8 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fndc8Q9D2H8 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fndc8Q9D2H8 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fndc8Q9D2H8 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fndc8Q9D2H8 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fndc8Q9D2H8 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fndc8Q9D2H8 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fndc8Q9D2H8 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fndc8Q9D2H8 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fndc8Q9D2H8 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fndc8Q9D2H8 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fndc8Q9D2H8 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fndc8Q9D2H8 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fndc8Q9D2H8 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fndc8Q9D2H8 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Fndc8Q9D2H8 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fndc8Q9D2H8 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms