Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pramef12Q9D2F1 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pramef12Q9D2F1 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pramef12Q9D2F1 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pramef12Q9D2F1 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pramef12Q9D2F1 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pramef12Q9D2F1 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pramef12Q9D2F1 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pramef12Q9D2F1 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pramef12Q9D2F1 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pramef12Q9D2F1 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pramef12Q9D2F1 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pramef12Q9D2F1 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pramef12Q9D2F1 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pramef12Q9D2F1 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pramef12Q9D2F1 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pramef12Q9D2F1 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pramef12Q9D2F1 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Pramef12Q9D2F1 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pramef12Q9D2F1 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pramef12Q9D2F1 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pramef12Q9D2F1 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pramef12Q9D2F1 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pramef12Q9D2F1 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pramef12Q9D2F1 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pramef12Q9D2F1 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pramef12Q9D2F1 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pramef12Q9D2F1 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pramef12Q9D2F1 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pramef12Q9D2F1 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pramef12Q9D2F1 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Pramef12Q9D2F1 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pramef12Q9D2F1 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Pramef12Q9D2F1 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pramef12Q9D2F1 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pramef12Q9D2F1 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pramef12Q9D2F1 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pramef12Q9D2F1 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pramef12Q9D2F1 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pramef12Q9D2F1 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pramef12Q9D2F1 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pramef12Q9D2F1 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pramef12Q9D2F1 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pramef12Q9D2F1 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pramef12Q9D2F1 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pramef12Q9D2F1 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pramef12Q9D2F1 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pramef12Q9D2F1 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pramef12Q9D2F1 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pramef12Q9D2F1 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pramef12Q9D2F1 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pramef12Q9D2F1 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pramef12Q9D2F1 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pramef12Q9D2F1 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pramef12Q9D2F1 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pramef12Q9D2F1 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Pramef12Q9D2F1 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pramef12Q9D2F1 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pramef12Q9D2F1 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pramef12Q9D2F1 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pramef12Q9D2F1 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pramef12Q9D2F1 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pramef12Q9D2F1 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Pramef12Q9D2F1 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Pramef12Q9D2F1 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pramef12Q9D2F1 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pramef12Q9D2F1 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pramef12Q9D2F1 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pramef12Q9D2F1 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pramef12Q9D2F1 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pramef12Q9D2F1 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pramef12Q9D2F1 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pramef12Q9D2F1 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pramef12Q9D2F1 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pramef12Q9D2F1 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Pramef12Q9D2F1 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pramef12Q9D2F1 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pramef12Q9D2F1 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pramef12Q9D2F1 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pramef12Q9D2F1 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pramef12Q9D2F1 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pramef12Q9D2F1 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pramef12Q9D2F1 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pramef12Q9D2F1 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pramef12Q9D2F1 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pramef12Q9D2F1 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Pramef12Q9D2F1 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pramef12Q9D2F1 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pramef12Q9D2F1 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pramef12Q9D2F1 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Pramef12Q9D2F1 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pramef12Q9D2F1 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pramef12Q9D2F1 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pramef12Q9D2F1 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Pramef12Q9D2F1 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pramef12Q9D2F1 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pramef12Q9D2F1 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pramef12Q9D2F1 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pramef12Q9D2F1 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pramef12Q9D2F1 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms