Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2D9

Klhdc8b, Kelch domain-containing protein 8B, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc8bQ9D2D9 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Klhdc8bQ9D2D9 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klhdc8bQ9D2D9 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klhdc8bQ9D2D9 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Klhdc8bQ9D2D9 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Klhdc8bQ9D2D9 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Klhdc8bQ9D2D9 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Klhdc8bQ9D2D9 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Klhdc8bQ9D2D9 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Klhdc8bQ9D2D9 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Klhdc8bQ9D2D9 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhdc8bQ9D2D9 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhdc8bQ9D2D9 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhdc8bQ9D2D9 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhdc8bQ9D2D9 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhdc8bQ9D2D9 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhdc8bQ9D2D9 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhdc8bQ9D2D9 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhdc8bQ9D2D9 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhdc8bQ9D2D9 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhdc8bQ9D2D9 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhdc8bQ9D2D9 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhdc8bQ9D2D9 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhdc8bQ9D2D9 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhdc8bQ9D2D9 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhdc8bQ9D2D9 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhdc8bQ9D2D9 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhdc8bQ9D2D9 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhdc8bQ9D2D9 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhdc8bQ9D2D9 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhdc8bQ9D2D9 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhdc8bQ9D2D9 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhdc8bQ9D2D9 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klhdc8bQ9D2D9 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klhdc8bQ9D2D9 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klhdc8bQ9D2D9 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klhdc8bQ9D2D9 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klhdc8bQ9D2D9 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klhdc8bQ9D2D9 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Klhdc8bQ9D2D9 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klhdc8bQ9D2D9 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Klhdc8bQ9D2D9 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Klhdc8bQ9D2D9 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Klhdc8bQ9D2D9 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Klhdc8bQ9D2D9 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Klhdc8bQ9D2D9 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klhdc8bQ9D2D9 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Klhdc8bQ9D2D9 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klhdc8bQ9D2D9 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klhdc8bQ9D2D9 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Klhdc8bQ9D2D9 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klhdc8bQ9D2D9 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klhdc8bQ9D2D9 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klhdc8bQ9D2D9 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klhdc8bQ9D2D9 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Klhdc8bQ9D2D9 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klhdc8bQ9D2D9 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhdc8bQ9D2D9 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhdc8bQ9D2D9 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhdc8bQ9D2D9 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhdc8bQ9D2D9 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhdc8bQ9D2D9 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhdc8bQ9D2D9 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhdc8bQ9D2D9 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhdc8bQ9D2D9 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhdc8bQ9D2D9 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhdc8bQ9D2D9 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhdc8bQ9D2D9 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhdc8bQ9D2D9 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhdc8bQ9D2D9 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhdc8bQ9D2D9 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhdc8bQ9D2D9 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhdc8bQ9D2D9 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhdc8bQ9D2D9 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhdc8bQ9D2D9 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhdc8bQ9D2D9 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhdc8bQ9D2D9 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhdc8bQ9D2D9 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhdc8bQ9D2D9 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhdc8bQ9D2D9 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhdc8bQ9D2D9 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhdc8bQ9D2D9 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhdc8bQ9D2D9 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhdc8bQ9D2D9 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhdc8bQ9D2D9 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhdc8bQ9D2D9 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhdc8bQ9D2D9 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhdc8bQ9D2D9 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhdc8bQ9D2D9 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhdc8bQ9D2D9 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhdc8bQ9D2D9 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhdc8bQ9D2D9 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhdc8bQ9D2D9 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhdc8bQ9D2D9 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhdc8bQ9D2D9 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhdc8bQ9D2D9 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhdc8bQ9D2D9 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhdc8bQ9D2D9 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhdc8bQ9D2D9 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhdc8bQ9D2D9 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms