Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E5

Lmbr1l, Protein LMBR1L, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1lQ9D1E5 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lmbr1lQ9D1E5 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lmbr1lQ9D1E5 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lmbr1lQ9D1E5 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lmbr1lQ9D1E5 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lmbr1lQ9D1E5 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lmbr1lQ9D1E5 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lmbr1lQ9D1E5 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lmbr1lQ9D1E5 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lmbr1lQ9D1E5 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lmbr1lQ9D1E5 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lmbr1lQ9D1E5 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lmbr1lQ9D1E5 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Lmbr1lQ9D1E5 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Lmbr1lQ9D1E5 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lmbr1lQ9D1E5 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lmbr1lQ9D1E5 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lmbr1lQ9D1E5 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lmbr1lQ9D1E5 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lmbr1lQ9D1E5 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Lmbr1lQ9D1E5 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lmbr1lQ9D1E5 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lmbr1lQ9D1E5 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lmbr1lQ9D1E5 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lmbr1lQ9D1E5 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Lmbr1lQ9D1E5 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lmbr1lQ9D1E5 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lmbr1lQ9D1E5 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lmbr1lQ9D1E5 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lmbr1lQ9D1E5 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lmbr1lQ9D1E5 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lmbr1lQ9D1E5 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lmbr1lQ9D1E5 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lmbr1lQ9D1E5 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lmbr1lQ9D1E5 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lmbr1lQ9D1E5 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lmbr1lQ9D1E5 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lmbr1lQ9D1E5 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lmbr1lQ9D1E5 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lmbr1lQ9D1E5 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lmbr1lQ9D1E5 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lmbr1lQ9D1E5 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lmbr1lQ9D1E5 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lmbr1lQ9D1E5 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Lmbr1lQ9D1E5 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lmbr1lQ9D1E5 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lmbr1lQ9D1E5 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lmbr1lQ9D1E5 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lmbr1lQ9D1E5 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lmbr1lQ9D1E5 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lmbr1lQ9D1E5 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lmbr1lQ9D1E5 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lmbr1lQ9D1E5 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lmbr1lQ9D1E5 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lmbr1lQ9D1E5 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lmbr1lQ9D1E5 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lmbr1lQ9D1E5 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lmbr1lQ9D1E5 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lmbr1lQ9D1E5 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lmbr1lQ9D1E5 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lmbr1lQ9D1E5 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lmbr1lQ9D1E5 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lmbr1lQ9D1E5 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lmbr1lQ9D1E5 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Lmbr1lQ9D1E5 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lmbr1lQ9D1E5 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lmbr1lQ9D1E5 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lmbr1lQ9D1E5 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lmbr1lQ9D1E5 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lmbr1lQ9D1E5 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lmbr1lQ9D1E5 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lmbr1lQ9D1E5 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lmbr1lQ9D1E5 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lmbr1lQ9D1E5 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lmbr1lQ9D1E5 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lmbr1lQ9D1E5 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lmbr1lQ9D1E5 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lmbr1lQ9D1E5 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lmbr1lQ9D1E5 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lmbr1lQ9D1E5 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lmbr1lQ9D1E5 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lmbr1lQ9D1E5 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lmbr1lQ9D1E5 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lmbr1lQ9D1E5 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lmbr1lQ9D1E5 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lmbr1lQ9D1E5 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lmbr1lQ9D1E5 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lmbr1lQ9D1E5 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lmbr1lQ9D1E5 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lmbr1lQ9D1E5 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lmbr1lQ9D1E5 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lmbr1lQ9D1E5 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lmbr1lQ9D1E5 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lmbr1lQ9D1E5 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Lmbr1lQ9D1E5 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lmbr1lQ9D1E5 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lmbr1lQ9D1E5 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lmbr1lQ9D1E5 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lmbr1lQ9D1E5 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lmbr1lQ9D1E5 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms