Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mrpl28Q9D1B9 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms