Protein–RNA interactions for Protein: Q9D162

Ccdc167, Coiled-coil domain-containing protein 167, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc167Q9D162 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc167Q9D162 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc167Q9D162 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc167Q9D162 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc167Q9D162 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc167Q9D162 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc167Q9D162 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc167Q9D162 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc167Q9D162 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc167Q9D162 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc167Q9D162 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc167Q9D162 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc167Q9D162 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc167Q9D162 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc167Q9D162 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc167Q9D162 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc167Q9D162 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc167Q9D162 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc167Q9D162 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc167Q9D162 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc167Q9D162 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc167Q9D162 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc167Q9D162 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc167Q9D162 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc167Q9D162 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc167Q9D162 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc167Q9D162 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc167Q9D162 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc167Q9D162 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc167Q9D162 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc167Q9D162 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc167Q9D162 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc167Q9D162 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc167Q9D162 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc167Q9D162 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc167Q9D162 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc167Q9D162 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc167Q9D162 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc167Q9D162 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc167Q9D162 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc167Q9D162 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc167Q9D162 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc167Q9D162 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc167Q9D162 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc167Q9D162 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc167Q9D162 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc167Q9D162 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc167Q9D162 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc167Q9D162 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc167Q9D162 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc167Q9D162 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc167Q9D162 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccdc167Q9D162 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccdc167Q9D162 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccdc167Q9D162 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccdc167Q9D162 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccdc167Q9D162 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccdc167Q9D162 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccdc167Q9D162 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccdc167Q9D162 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccdc167Q9D162 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccdc167Q9D162 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccdc167Q9D162 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccdc167Q9D162 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccdc167Q9D162 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccdc167Q9D162 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccdc167Q9D162 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccdc167Q9D162 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccdc167Q9D162 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccdc167Q9D162 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccdc167Q9D162 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccdc167Q9D162 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccdc167Q9D162 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccdc167Q9D162 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccdc167Q9D162 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccdc167Q9D162 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccdc167Q9D162 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccdc167Q9D162 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccdc167Q9D162 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccdc167Q9D162 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccdc167Q9D162 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccdc167Q9D162 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccdc167Q9D162 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccdc167Q9D162 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccdc167Q9D162 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccdc167Q9D162 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccdc167Q9D162 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccdc167Q9D162 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccdc167Q9D162 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccdc167Q9D162 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccdc167Q9D162 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccdc167Q9D162 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccdc167Q9D162 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccdc167Q9D162 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccdc167Q9D162 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccdc167Q9D162 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccdc167Q9D162 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccdc167Q9D162 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccdc167Q9D162 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccdc167Q9D162 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms