Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0R8

Lsm12, Protein LSM12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm12Q9D0R8 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lsm12Q9D0R8 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms