Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0M0

Exosc7, Exosome complex exonuclease RRP42, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc7Q9D0M0 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Exosc7Q9D0M0 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Exosc7Q9D0M0 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Exosc7Q9D0M0 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Exosc7Q9D0M0 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Exosc7Q9D0M0 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Exosc7Q9D0M0 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Exosc7Q9D0M0 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Exosc7Q9D0M0 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Exosc7Q9D0M0 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Exosc7Q9D0M0 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Exosc7Q9D0M0 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Exosc7Q9D0M0 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Exosc7Q9D0M0 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Exosc7Q9D0M0 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Exosc7Q9D0M0 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Exosc7Q9D0M0 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Exosc7Q9D0M0 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Exosc7Q9D0M0 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Exosc7Q9D0M0 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Exosc7Q9D0M0 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Exosc7Q9D0M0 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Exosc7Q9D0M0 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Exosc7Q9D0M0 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Exosc7Q9D0M0 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Exosc7Q9D0M0 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Exosc7Q9D0M0 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Exosc7Q9D0M0 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Exosc7Q9D0M0 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Exosc7Q9D0M0 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Exosc7Q9D0M0 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Exosc7Q9D0M0 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Exosc7Q9D0M0 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Exosc7Q9D0M0 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Exosc7Q9D0M0 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Exosc7Q9D0M0 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Exosc7Q9D0M0 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Exosc7Q9D0M0 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Exosc7Q9D0M0 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Exosc7Q9D0M0 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Exosc7Q9D0M0 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Exosc7Q9D0M0 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Exosc7Q9D0M0 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Exosc7Q9D0M0 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Exosc7Q9D0M0 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Exosc7Q9D0M0 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Exosc7Q9D0M0 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Exosc7Q9D0M0 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Exosc7Q9D0M0 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Exosc7Q9D0M0 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Exosc7Q9D0M0 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Exosc7Q9D0M0 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Exosc7Q9D0M0 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Exosc7Q9D0M0 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Exosc7Q9D0M0 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Exosc7Q9D0M0 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Exosc7Q9D0M0 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Exosc7Q9D0M0 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Exosc7Q9D0M0 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Exosc7Q9D0M0 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Exosc7Q9D0M0 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Exosc7Q9D0M0 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Exosc7Q9D0M0 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Exosc7Q9D0M0 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Exosc7Q9D0M0 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Exosc7Q9D0M0 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Exosc7Q9D0M0 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Exosc7Q9D0M0 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Exosc7Q9D0M0 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Exosc7Q9D0M0 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Exosc7Q9D0M0 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Exosc7Q9D0M0 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Exosc7Q9D0M0 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Exosc7Q9D0M0 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Exosc7Q9D0M0 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Exosc7Q9D0M0 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Exosc7Q9D0M0 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Exosc7Q9D0M0 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Exosc7Q9D0M0 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Exosc7Q9D0M0 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Exosc7Q9D0M0 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Exosc7Q9D0M0 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Exosc7Q9D0M0 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Exosc7Q9D0M0 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Exosc7Q9D0M0 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Exosc7Q9D0M0 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Exosc7Q9D0M0 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Exosc7Q9D0M0 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Exosc7Q9D0M0 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Exosc7Q9D0M0 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Exosc7Q9D0M0 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Exosc7Q9D0M0 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exosc7Q9D0M0 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exosc7Q9D0M0 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exosc7Q9D0M0 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exosc7Q9D0M0 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exosc7Q9D0M0 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exosc7Q9D0M0 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exosc7Q9D0M0 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Exosc7Q9D0M0 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms