Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0B6

Pbdc1, Protein PBDC1, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbdc1Q9D0B6 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pbdc1Q9D0B6 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pbdc1Q9D0B6 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pbdc1Q9D0B6 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pbdc1Q9D0B6 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pbdc1Q9D0B6 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pbdc1Q9D0B6 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pbdc1Q9D0B6 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pbdc1Q9D0B6 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pbdc1Q9D0B6 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pbdc1Q9D0B6 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pbdc1Q9D0B6 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pbdc1Q9D0B6 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pbdc1Q9D0B6 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pbdc1Q9D0B6 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pbdc1Q9D0B6 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pbdc1Q9D0B6 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pbdc1Q9D0B6 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Pbdc1Q9D0B6 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pbdc1Q9D0B6 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pbdc1Q9D0B6 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pbdc1Q9D0B6 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pbdc1Q9D0B6 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pbdc1Q9D0B6 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pbdc1Q9D0B6 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pbdc1Q9D0B6 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pbdc1Q9D0B6 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pbdc1Q9D0B6 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pbdc1Q9D0B6 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Pbdc1Q9D0B6 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pbdc1Q9D0B6 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pbdc1Q9D0B6 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pbdc1Q9D0B6 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pbdc1Q9D0B6 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pbdc1Q9D0B6 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pbdc1Q9D0B6 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pbdc1Q9D0B6 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pbdc1Q9D0B6 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pbdc1Q9D0B6 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pbdc1Q9D0B6 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pbdc1Q9D0B6 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pbdc1Q9D0B6 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pbdc1Q9D0B6 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pbdc1Q9D0B6 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pbdc1Q9D0B6 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Pbdc1Q9D0B6 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.03■□□□□ -0
Pbdc1Q9D0B6 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pbdc1Q9D0B6 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pbdc1Q9D0B6 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pbdc1Q9D0B6 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Pbdc1Q9D0B6 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pbdc1Q9D0B6 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Pbdc1Q9D0B6 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Pbdc1Q9D0B6 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Pbdc1Q9D0B6 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pbdc1Q9D0B6 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pbdc1Q9D0B6 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pbdc1Q9D0B6 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Pbdc1Q9D0B6 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pbdc1Q9D0B6 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pbdc1Q9D0B6 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pbdc1Q9D0B6 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pbdc1Q9D0B6 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Pbdc1Q9D0B6 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Pbdc1Q9D0B6 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Pbdc1Q9D0B6 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pbdc1Q9D0B6 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pbdc1Q9D0B6 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pbdc1Q9D0B6 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pbdc1Q9D0B6 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Pbdc1Q9D0B6 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pbdc1Q9D0B6 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pbdc1Q9D0B6 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pbdc1Q9D0B6 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pbdc1Q9D0B6 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pbdc1Q9D0B6 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pbdc1Q9D0B6 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pbdc1Q9D0B6 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pbdc1Q9D0B6 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pbdc1Q9D0B6 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pbdc1Q9D0B6 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pbdc1Q9D0B6 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pbdc1Q9D0B6 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pbdc1Q9D0B6 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pbdc1Q9D0B6 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pbdc1Q9D0B6 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pbdc1Q9D0B6 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pbdc1Q9D0B6 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pbdc1Q9D0B6 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pbdc1Q9D0B6 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pbdc1Q9D0B6 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pbdc1Q9D0B6 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pbdc1Q9D0B6 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Pbdc1Q9D0B6 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pbdc1Q9D0B6 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pbdc1Q9D0B6 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pbdc1Q9D0B6 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pbdc1Q9D0B6 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pbdc1Q9D0B6 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pbdc1Q9D0B6 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms