Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZX0

Elp3, Elongator complex protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elp3Q9CZX0 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Elp3Q9CZX0 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Elp3Q9CZX0 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Elp3Q9CZX0 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Elp3Q9CZX0 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Elp3Q9CZX0 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Elp3Q9CZX0 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Elp3Q9CZX0 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Elp3Q9CZX0 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Elp3Q9CZX0 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Elp3Q9CZX0 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Elp3Q9CZX0 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Elp3Q9CZX0 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Elp3Q9CZX0 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Elp3Q9CZX0 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Elp3Q9CZX0 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Elp3Q9CZX0 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Elp3Q9CZX0 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Elp3Q9CZX0 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Elp3Q9CZX0 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Elp3Q9CZX0 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Elp3Q9CZX0 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Elp3Q9CZX0 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Elp3Q9CZX0 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Elp3Q9CZX0 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Elp3Q9CZX0 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Elp3Q9CZX0 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Elp3Q9CZX0 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Elp3Q9CZX0 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Elp3Q9CZX0 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Elp3Q9CZX0 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Elp3Q9CZX0 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Elp3Q9CZX0 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Elp3Q9CZX0 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Elp3Q9CZX0 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Elp3Q9CZX0 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Elp3Q9CZX0 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Elp3Q9CZX0 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Elp3Q9CZX0 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Elp3Q9CZX0 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Elp3Q9CZX0 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Elp3Q9CZX0 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Elp3Q9CZX0 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Elp3Q9CZX0 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Elp3Q9CZX0 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Elp3Q9CZX0 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Elp3Q9CZX0 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Elp3Q9CZX0 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Elp3Q9CZX0 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Elp3Q9CZX0 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Elp3Q9CZX0 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Elp3Q9CZX0 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Elp3Q9CZX0 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Elp3Q9CZX0 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Elp3Q9CZX0 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Elp3Q9CZX0 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Elp3Q9CZX0 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Elp3Q9CZX0 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Elp3Q9CZX0 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Elp3Q9CZX0 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Elp3Q9CZX0 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Elp3Q9CZX0 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Elp3Q9CZX0 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Elp3Q9CZX0 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Elp3Q9CZX0 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Elp3Q9CZX0 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Elp3Q9CZX0 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Elp3Q9CZX0 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Elp3Q9CZX0 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Elp3Q9CZX0 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Elp3Q9CZX0 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Elp3Q9CZX0 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Elp3Q9CZX0 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Elp3Q9CZX0 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Elp3Q9CZX0 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Elp3Q9CZX0 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Elp3Q9CZX0 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Elp3Q9CZX0 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Elp3Q9CZX0 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Elp3Q9CZX0 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Elp3Q9CZX0 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Elp3Q9CZX0 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Elp3Q9CZX0 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Elp3Q9CZX0 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Elp3Q9CZX0 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Elp3Q9CZX0 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Elp3Q9CZX0 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Elp3Q9CZX0 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Elp3Q9CZX0 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Elp3Q9CZX0 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Elp3Q9CZX0 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Elp3Q9CZX0 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Elp3Q9CZX0 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Elp3Q9CZX0 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Elp3Q9CZX0 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Elp3Q9CZX0 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Elp3Q9CZX0 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Elp3Q9CZX0 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Elp3Q9CZX0 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Elp3Q9CZX0 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms