Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY21

Bud23, Probable 18S rRNA (guanine-N(7))-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bud23Q9CY21 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Bud23Q9CY21 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Bud23Q9CY21 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Bud23Q9CY21 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Bud23Q9CY21 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Bud23Q9CY21 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Bud23Q9CY21 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Bud23Q9CY21 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Bud23Q9CY21 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Bud23Q9CY21 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Bud23Q9CY21 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Bud23Q9CY21 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Bud23Q9CY21 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Bud23Q9CY21 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Bud23Q9CY21 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Bud23Q9CY21 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Bud23Q9CY21 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Bud23Q9CY21 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Bud23Q9CY21 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Bud23Q9CY21 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Bud23Q9CY21 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Bud23Q9CY21 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Bud23Q9CY21 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Bud23Q9CY21 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Bud23Q9CY21 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Bud23Q9CY21 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Bud23Q9CY21 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Bud23Q9CY21 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Bud23Q9CY21 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Bud23Q9CY21 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Bud23Q9CY21 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Bud23Q9CY21 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Bud23Q9CY21 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Bud23Q9CY21 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Bud23Q9CY21 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Bud23Q9CY21 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Bud23Q9CY21 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Bud23Q9CY21 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Bud23Q9CY21 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Bud23Q9CY21 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Bud23Q9CY21 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Bud23Q9CY21 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Bud23Q9CY21 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bud23Q9CY21 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bud23Q9CY21 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bud23Q9CY21 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bud23Q9CY21 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Bud23Q9CY21 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bud23Q9CY21 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bud23Q9CY21 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bud23Q9CY21 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Bud23Q9CY21 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bud23Q9CY21 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bud23Q9CY21 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bud23Q9CY21 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bud23Q9CY21 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bud23Q9CY21 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Bud23Q9CY21 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
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Bud23Q9CY21 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bud23Q9CY21 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bud23Q9CY21 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bud23Q9CY21 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Bud23Q9CY21 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bud23Q9CY21 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bud23Q9CY21 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bud23Q9CY21 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bud23Q9CY21 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bud23Q9CY21 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Bud23Q9CY21 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bud23Q9CY21 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bud23Q9CY21 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bud23Q9CY21 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bud23Q9CY21 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Bud23Q9CY21 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bud23Q9CY21 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Bud23Q9CY21 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bud23Q9CY21 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bud23Q9CY21 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bud23Q9CY21 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bud23Q9CY21 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bud23Q9CY21 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bud23Q9CY21 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bud23Q9CY21 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bud23Q9CY21 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bud23Q9CY21 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bud23Q9CY21 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bud23Q9CY21 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bud23Q9CY21 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bud23Q9CY21 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bud23Q9CY21 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bud23Q9CY21 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bud23Q9CY21 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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