Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXV1

Sdhd, Succinate dehydrogenase [ubiquinone] cytochrome b small subunit, mitochondrial, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SdhdQ9CXV1 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SdhdQ9CXV1 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SdhdQ9CXV1 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SdhdQ9CXV1 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SdhdQ9CXV1 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SdhdQ9CXV1 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SdhdQ9CXV1 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SdhdQ9CXV1 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SdhdQ9CXV1 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SdhdQ9CXV1 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SdhdQ9CXV1 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SdhdQ9CXV1 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SdhdQ9CXV1 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SdhdQ9CXV1 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SdhdQ9CXV1 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SdhdQ9CXV1 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SdhdQ9CXV1 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SdhdQ9CXV1 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SdhdQ9CXV1 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SdhdQ9CXV1 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SdhdQ9CXV1 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SdhdQ9CXV1 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SdhdQ9CXV1 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SdhdQ9CXV1 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SdhdQ9CXV1 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SdhdQ9CXV1 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SdhdQ9CXV1 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SdhdQ9CXV1 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SdhdQ9CXV1 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SdhdQ9CXV1 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SdhdQ9CXV1 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SdhdQ9CXV1 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SdhdQ9CXV1 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SdhdQ9CXV1 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SdhdQ9CXV1 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SdhdQ9CXV1 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SdhdQ9CXV1 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SdhdQ9CXV1 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SdhdQ9CXV1 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SdhdQ9CXV1 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SdhdQ9CXV1 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SdhdQ9CXV1 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SdhdQ9CXV1 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SdhdQ9CXV1 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SdhdQ9CXV1 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SdhdQ9CXV1 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SdhdQ9CXV1 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SdhdQ9CXV1 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SdhdQ9CXV1 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SdhdQ9CXV1 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SdhdQ9CXV1 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SdhdQ9CXV1 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SdhdQ9CXV1 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SdhdQ9CXV1 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SdhdQ9CXV1 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
SdhdQ9CXV1 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
SdhdQ9CXV1 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SdhdQ9CXV1 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SdhdQ9CXV1 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
SdhdQ9CXV1 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SdhdQ9CXV1 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SdhdQ9CXV1 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SdhdQ9CXV1 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SdhdQ9CXV1 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SdhdQ9CXV1 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SdhdQ9CXV1 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SdhdQ9CXV1 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SdhdQ9CXV1 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SdhdQ9CXV1 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SdhdQ9CXV1 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SdhdQ9CXV1 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SdhdQ9CXV1 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SdhdQ9CXV1 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SdhdQ9CXV1 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SdhdQ9CXV1 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SdhdQ9CXV1 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SdhdQ9CXV1 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SdhdQ9CXV1 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SdhdQ9CXV1 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SdhdQ9CXV1 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SdhdQ9CXV1 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SdhdQ9CXV1 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SdhdQ9CXV1 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SdhdQ9CXV1 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SdhdQ9CXV1 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SdhdQ9CXV1 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SdhdQ9CXV1 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SdhdQ9CXV1 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SdhdQ9CXV1 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SdhdQ9CXV1 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SdhdQ9CXV1 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SdhdQ9CXV1 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SdhdQ9CXV1 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SdhdQ9CXV1 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SdhdQ9CXV1 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SdhdQ9CXV1 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SdhdQ9CXV1 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SdhdQ9CXV1 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SdhdQ9CXV1 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SdhdQ9CXV1 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms