Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE7

Tmed5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed5Q9CXE7 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmed5Q9CXE7 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmed5Q9CXE7 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmed5Q9CXE7 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmed5Q9CXE7 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmed5Q9CXE7 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmed5Q9CXE7 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmed5Q9CXE7 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmed5Q9CXE7 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmed5Q9CXE7 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmed5Q9CXE7 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmed5Q9CXE7 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmed5Q9CXE7 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmed5Q9CXE7 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmed5Q9CXE7 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmed5Q9CXE7 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmed5Q9CXE7 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmed5Q9CXE7 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmed5Q9CXE7 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmed5Q9CXE7 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmed5Q9CXE7 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmed5Q9CXE7 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmed5Q9CXE7 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmed5Q9CXE7 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmed5Q9CXE7 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmed5Q9CXE7 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmed5Q9CXE7 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmed5Q9CXE7 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmed5Q9CXE7 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmed5Q9CXE7 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmed5Q9CXE7 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmed5Q9CXE7 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmed5Q9CXE7 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmed5Q9CXE7 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmed5Q9CXE7 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmed5Q9CXE7 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmed5Q9CXE7 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmed5Q9CXE7 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmed5Q9CXE7 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmed5Q9CXE7 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmed5Q9CXE7 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmed5Q9CXE7 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmed5Q9CXE7 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmed5Q9CXE7 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmed5Q9CXE7 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmed5Q9CXE7 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmed5Q9CXE7 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmed5Q9CXE7 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmed5Q9CXE7 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmed5Q9CXE7 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmed5Q9CXE7 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmed5Q9CXE7 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmed5Q9CXE7 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmed5Q9CXE7 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmed5Q9CXE7 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Tmed5Q9CXE7 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Tmed5Q9CXE7 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmed5Q9CXE7 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmed5Q9CXE7 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmed5Q9CXE7 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmed5Q9CXE7 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmed5Q9CXE7 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms