Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE0

Prdm5, PR domain zinc finger protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm5Q9CXE0 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prdm5Q9CXE0 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prdm5Q9CXE0 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms