Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW6

Pin4, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase NIMA-interacting 4, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pin4Q9CWW6 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pin4Q9CWW6 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pin4Q9CWW6 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pin4Q9CWW6 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pin4Q9CWW6 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pin4Q9CWW6 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pin4Q9CWW6 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pin4Q9CWW6 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pin4Q9CWW6 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pin4Q9CWW6 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pin4Q9CWW6 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pin4Q9CWW6 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pin4Q9CWW6 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Pin4Q9CWW6 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pin4Q9CWW6 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pin4Q9CWW6 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Pin4Q9CWW6 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pin4Q9CWW6 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pin4Q9CWW6 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pin4Q9CWW6 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Pin4Q9CWW6 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pin4Q9CWW6 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pin4Q9CWW6 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Pin4Q9CWW6 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pin4Q9CWW6 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pin4Q9CWW6 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pin4Q9CWW6 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pin4Q9CWW6 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pin4Q9CWW6 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pin4Q9CWW6 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pin4Q9CWW6 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Pin4Q9CWW6 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pin4Q9CWW6 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pin4Q9CWW6 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pin4Q9CWW6 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pin4Q9CWW6 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pin4Q9CWW6 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pin4Q9CWW6 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pin4Q9CWW6 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pin4Q9CWW6 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Pin4Q9CWW6 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Pin4Q9CWW6 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Pin4Q9CWW6 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Pin4Q9CWW6 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Pin4Q9CWW6 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pin4Q9CWW6 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pin4Q9CWW6 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Pin4Q9CWW6 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pin4Q9CWW6 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pin4Q9CWW6 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pin4Q9CWW6 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pin4Q9CWW6 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Pin4Q9CWW6 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pin4Q9CWW6 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pin4Q9CWW6 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pin4Q9CWW6 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Pin4Q9CWW6 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pin4Q9CWW6 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pin4Q9CWW6 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pin4Q9CWW6 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pin4Q9CWW6 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pin4Q9CWW6 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Pin4Q9CWW6 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pin4Q9CWW6 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pin4Q9CWW6 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pin4Q9CWW6 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pin4Q9CWW6 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pin4Q9CWW6 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pin4Q9CWW6 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pin4Q9CWW6 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pin4Q9CWW6 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pin4Q9CWW6 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pin4Q9CWW6 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pin4Q9CWW6 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pin4Q9CWW6 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pin4Q9CWW6 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pin4Q9CWW6 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pin4Q9CWW6 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Pin4Q9CWW6 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pin4Q9CWW6 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pin4Q9CWW6 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pin4Q9CWW6 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pin4Q9CWW6 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Pin4Q9CWW6 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pin4Q9CWW6 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pin4Q9CWW6 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pin4Q9CWW6 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pin4Q9CWW6 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Pin4Q9CWW6 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pin4Q9CWW6 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pin4Q9CWW6 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pin4Q9CWW6 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pin4Q9CWW6 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pin4Q9CWW6 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pin4Q9CWW6 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pin4Q9CWW6 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pin4Q9CWW6 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pin4Q9CWW6 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pin4Q9CWW6 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pin4Q9CWW6 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms