Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU5

Khdc3, KH domain-containing protein 3, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc3Q9CWU5 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Khdc3Q9CWU5 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Khdc3Q9CWU5 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Khdc3Q9CWU5 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Khdc3Q9CWU5 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Khdc3Q9CWU5 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Khdc3Q9CWU5 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Khdc3Q9CWU5 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Khdc3Q9CWU5 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Khdc3Q9CWU5 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Khdc3Q9CWU5 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Khdc3Q9CWU5 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Khdc3Q9CWU5 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Khdc3Q9CWU5 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Khdc3Q9CWU5 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Khdc3Q9CWU5 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Khdc3Q9CWU5 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Khdc3Q9CWU5 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Khdc3Q9CWU5 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Khdc3Q9CWU5 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Khdc3Q9CWU5 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Khdc3Q9CWU5 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Khdc3Q9CWU5 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Khdc3Q9CWU5 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Khdc3Q9CWU5 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Khdc3Q9CWU5 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Khdc3Q9CWU5 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Khdc3Q9CWU5 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Khdc3Q9CWU5 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Khdc3Q9CWU5 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Khdc3Q9CWU5 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Khdc3Q9CWU5 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Khdc3Q9CWU5 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Khdc3Q9CWU5 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Khdc3Q9CWU5 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Khdc3Q9CWU5 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Khdc3Q9CWU5 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Khdc3Q9CWU5 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Khdc3Q9CWU5 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Khdc3Q9CWU5 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Khdc3Q9CWU5 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Khdc3Q9CWU5 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Khdc3Q9CWU5 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Khdc3Q9CWU5 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Khdc3Q9CWU5 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Khdc3Q9CWU5 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Khdc3Q9CWU5 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Khdc3Q9CWU5 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Khdc3Q9CWU5 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Khdc3Q9CWU5 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Khdc3Q9CWU5 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Khdc3Q9CWU5 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Khdc3Q9CWU5 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Khdc3Q9CWU5 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Khdc3Q9CWU5 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Khdc3Q9CWU5 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Khdc3Q9CWU5 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Khdc3Q9CWU5 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Khdc3Q9CWU5 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Khdc3Q9CWU5 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Khdc3Q9CWU5 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Khdc3Q9CWU5 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Khdc3Q9CWU5 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Khdc3Q9CWU5 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Khdc3Q9CWU5 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Khdc3Q9CWU5 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Khdc3Q9CWU5 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Khdc3Q9CWU5 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Khdc3Q9CWU5 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Khdc3Q9CWU5 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Khdc3Q9CWU5 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Khdc3Q9CWU5 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Khdc3Q9CWU5 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Khdc3Q9CWU5 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Khdc3Q9CWU5 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Khdc3Q9CWU5 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Khdc3Q9CWU5 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Khdc3Q9CWU5 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Khdc3Q9CWU5 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Khdc3Q9CWU5 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Khdc3Q9CWU5 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Khdc3Q9CWU5 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Khdc3Q9CWU5 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Khdc3Q9CWU5 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Khdc3Q9CWU5 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Khdc3Q9CWU5 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Khdc3Q9CWU5 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Khdc3Q9CWU5 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Khdc3Q9CWU5 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Khdc3Q9CWU5 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Khdc3Q9CWU5 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Khdc3Q9CWU5 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Khdc3Q9CWU5 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Khdc3Q9CWU5 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Khdc3Q9CWU5 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Khdc3Q9CWU5 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Khdc3Q9CWU5 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Khdc3Q9CWU5 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Khdc3Q9CWU5 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Khdc3Q9CWU5 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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