Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU4

UPF0690 protein C1orf52 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CWU4 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9CWU4 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9CWU4 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9CWU4 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9CWU4 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9CWU4 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9CWU4 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9CWU4 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9CWU4 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9CWU4 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9CWU4 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9CWU4 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9CWU4 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9CWU4 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9CWU4 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9CWU4 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9CWU4 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9CWU4 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9CWU4 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9CWU4 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9CWU4 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9CWU4 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9CWU4 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9CWU4 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9CWU4 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9CWU4 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9CWU4 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9CWU4 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9CWU4 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9CWU4 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9CWU4 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9CWU4 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9CWU4 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9CWU4 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9CWU4 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9CWU4 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9CWU4 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9CWU4 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9CWU4 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9CWU4 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9CWU4 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9CWU4 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9CWU4 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9CWU4 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9CWU4 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9CWU4 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9CWU4 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9CWU4 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9CWU4 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9CWU4 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9CWU4 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9CWU4 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9CWU4 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9CWU4 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9CWU4 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9CWU4 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9CWU4 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9CWU4 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9CWU4 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9CWU4 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9CWU4 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9CWU4 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9CWU4 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9CWU4 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9CWU4 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9CWU4 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9CWU4 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9CWU4 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9CWU4 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9CWU4 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9CWU4 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9CWU4 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9CWU4 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9CWU4 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9CWU4 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9CWU4 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9CWU4 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9CWU4 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9CWU4 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9CWU4 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9CWU4 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9CWU4 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9CWU4 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9CWU4 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9CWU4 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9CWU4 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9CWU4 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9CWU4 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CWU4 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CWU4 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CWU4 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CWU4 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CWU4 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CWU4 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CWU4 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CWU4 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CWU4 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CWU4 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CWU4 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9CWU4 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms