Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM2

Cdca4, Cell division cycle-associated protein 4, mousemouse

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Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca4Q9CWM2 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cdca4Q9CWM2 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cdca4Q9CWM2 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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