Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWK8

Snx2, Sorting nexin-2, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx2Q9CWK8 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx2Q9CWK8 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx2Q9CWK8 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx2Q9CWK8 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx2Q9CWK8 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx2Q9CWK8 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx2Q9CWK8 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx2Q9CWK8 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx2Q9CWK8 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx2Q9CWK8 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx2Q9CWK8 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx2Q9CWK8 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx2Q9CWK8 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx2Q9CWK8 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx2Q9CWK8 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx2Q9CWK8 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx2Q9CWK8 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx2Q9CWK8 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx2Q9CWK8 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx2Q9CWK8 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx2Q9CWK8 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx2Q9CWK8 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx2Q9CWK8 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx2Q9CWK8 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx2Q9CWK8 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx2Q9CWK8 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx2Q9CWK8 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx2Q9CWK8 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx2Q9CWK8 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx2Q9CWK8 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx2Q9CWK8 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx2Q9CWK8 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx2Q9CWK8 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx2Q9CWK8 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx2Q9CWK8 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx2Q9CWK8 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx2Q9CWK8 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx2Q9CWK8 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx2Q9CWK8 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx2Q9CWK8 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx2Q9CWK8 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Snx2Q9CWK8 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx2Q9CWK8 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx2Q9CWK8 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx2Q9CWK8 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx2Q9CWK8 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx2Q9CWK8 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx2Q9CWK8 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx2Q9CWK8 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx2Q9CWK8 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx2Q9CWK8 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx2Q9CWK8 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx2Q9CWK8 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx2Q9CWK8 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx2Q9CWK8 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx2Q9CWK8 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx2Q9CWK8 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx2Q9CWK8 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx2Q9CWK8 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx2Q9CWK8 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx2Q9CWK8 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx2Q9CWK8 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx2Q9CWK8 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx2Q9CWK8 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx2Q9CWK8 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx2Q9CWK8 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx2Q9CWK8 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx2Q9CWK8 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx2Q9CWK8 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx2Q9CWK8 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx2Q9CWK8 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx2Q9CWK8 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx2Q9CWK8 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx2Q9CWK8 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx2Q9CWK8 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx2Q9CWK8 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx2Q9CWK8 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx2Q9CWK8 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx2Q9CWK8 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx2Q9CWK8 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx2Q9CWK8 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx2Q9CWK8 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx2Q9CWK8 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx2Q9CWK8 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx2Q9CWK8 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx2Q9CWK8 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx2Q9CWK8 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx2Q9CWK8 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx2Q9CWK8 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx2Q9CWK8 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx2Q9CWK8 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx2Q9CWK8 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx2Q9CWK8 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx2Q9CWK8 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx2Q9CWK8 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx2Q9CWK8 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx2Q9CWK8 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx2Q9CWK8 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx2Q9CWK8 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx2Q9CWK8 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms