Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NubplQ9CWD8 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NubplQ9CWD8 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NubplQ9CWD8 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NubplQ9CWD8 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NubplQ9CWD8 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NubplQ9CWD8 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NubplQ9CWD8 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NubplQ9CWD8 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
NubplQ9CWD8 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NubplQ9CWD8 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NubplQ9CWD8 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NubplQ9CWD8 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NubplQ9CWD8 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NubplQ9CWD8 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NubplQ9CWD8 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NubplQ9CWD8 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NubplQ9CWD8 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NubplQ9CWD8 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NubplQ9CWD8 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NubplQ9CWD8 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NubplQ9CWD8 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NubplQ9CWD8 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NubplQ9CWD8 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NubplQ9CWD8 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NubplQ9CWD8 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NubplQ9CWD8 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NubplQ9CWD8 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NubplQ9CWD8 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
NubplQ9CWD8 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NubplQ9CWD8 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NubplQ9CWD8 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NubplQ9CWD8 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NubplQ9CWD8 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NubplQ9CWD8 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NubplQ9CWD8 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NubplQ9CWD8 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NubplQ9CWD8 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NubplQ9CWD8 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NubplQ9CWD8 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NubplQ9CWD8 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NubplQ9CWD8 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NubplQ9CWD8 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NubplQ9CWD8 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NubplQ9CWD8 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NubplQ9CWD8 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NubplQ9CWD8 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
NubplQ9CWD8 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NubplQ9CWD8 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NubplQ9CWD8 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NubplQ9CWD8 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NubplQ9CWD8 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NubplQ9CWD8 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NubplQ9CWD8 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
NubplQ9CWD8 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NubplQ9CWD8 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NubplQ9CWD8 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NubplQ9CWD8 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NubplQ9CWD8 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NubplQ9CWD8 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NubplQ9CWD8 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NubplQ9CWD8 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NubplQ9CWD8 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
NubplQ9CWD8 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NubplQ9CWD8 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NubplQ9CWD8 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NubplQ9CWD8 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NubplQ9CWD8 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NubplQ9CWD8 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NubplQ9CWD8 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NubplQ9CWD8 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NubplQ9CWD8 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NubplQ9CWD8 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NubplQ9CWD8 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NubplQ9CWD8 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NubplQ9CWD8 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NubplQ9CWD8 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NubplQ9CWD8 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NubplQ9CWD8 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NubplQ9CWD8 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NubplQ9CWD8 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NubplQ9CWD8 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NubplQ9CWD8 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NubplQ9CWD8 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NubplQ9CWD8 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NubplQ9CWD8 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NubplQ9CWD8 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NubplQ9CWD8 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NubplQ9CWD8 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NubplQ9CWD8 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NubplQ9CWD8 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NubplQ9CWD8 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NubplQ9CWD8 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NubplQ9CWD8 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NubplQ9CWD8 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NubplQ9CWD8 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NubplQ9CWD8 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NubplQ9CWD8 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NubplQ9CWD8 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NubplQ9CWD8 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms