Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUU3

Sycp2, Synaptonemal complex protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp2Q9CUU3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Sycp2Q9CUU3 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Sycp2Q9CUU3 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Sycp2Q9CUU3 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Sycp2Q9CUU3 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Sycp2Q9CUU3 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Sycp2Q9CUU3 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Sycp2Q9CUU3 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Sycp2Q9CUU3 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Sycp2Q9CUU3 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Sycp2Q9CUU3 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Sycp2Q9CUU3 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Sycp2Q9CUU3 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Sycp2Q9CUU3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Sycp2Q9CUU3 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Sycp2Q9CUU3 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Sycp2Q9CUU3 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Sycp2Q9CUU3 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Sycp2Q9CUU3 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Sycp2Q9CUU3 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Sycp2Q9CUU3 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Sycp2Q9CUU3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Sycp2Q9CUU3 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Sycp2Q9CUU3 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Sycp2Q9CUU3 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Sycp2Q9CUU3 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Sycp2Q9CUU3 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Sycp2Q9CUU3 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Sycp2Q9CUU3 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Sycp2Q9CUU3 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Sycp2Q9CUU3 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Sycp2Q9CUU3 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Sycp2Q9CUU3 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Sycp2Q9CUU3 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Sycp2Q9CUU3 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Sycp2Q9CUU3 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Sycp2Q9CUU3 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Sycp2Q9CUU3 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Sycp2Q9CUU3 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Sycp2Q9CUU3 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Sycp2Q9CUU3 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Sycp2Q9CUU3 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Sycp2Q9CUU3 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Sycp2Q9CUU3 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Sycp2Q9CUU3 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Sycp2Q9CUU3 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Sycp2Q9CUU3 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Sycp2Q9CUU3 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Sycp2Q9CUU3 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Sycp2Q9CUU3 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Sycp2Q9CUU3 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Sycp2Q9CUU3 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Sycp2Q9CUU3 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Sycp2Q9CUU3 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Sycp2Q9CUU3 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Sycp2Q9CUU3 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Sycp2Q9CUU3 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Sycp2Q9CUU3 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Sycp2Q9CUU3 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Sycp2Q9CUU3 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Sycp2Q9CUU3 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Sycp2Q9CUU3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Sycp2Q9CUU3 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Sycp2Q9CUU3 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Sycp2Q9CUU3 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Sycp2Q9CUU3 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Sycp2Q9CUU3 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Sycp2Q9CUU3 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Sycp2Q9CUU3 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Sycp2Q9CUU3 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Sycp2Q9CUU3 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Sycp2Q9CUU3 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Sycp2Q9CUU3 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Sycp2Q9CUU3 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Sycp2Q9CUU3 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Sycp2Q9CUU3 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Sycp2Q9CUU3 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Sycp2Q9CUU3 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Sycp2Q9CUU3 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Sycp2Q9CUU3 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Sycp2Q9CUU3 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Sycp2Q9CUU3 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Sycp2Q9CUU3 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Sycp2Q9CUU3 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Sycp2Q9CUU3 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Sycp2Q9CUU3 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Sycp2Q9CUU3 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Sycp2Q9CUU3 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Sycp2Q9CUU3 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Sycp2Q9CUU3 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Sycp2Q9CUU3 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Sycp2Q9CUU3 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Sycp2Q9CUU3 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Sycp2Q9CUU3 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Sycp2Q9CUU3 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Sycp2Q9CUU3 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Sycp2Q9CUU3 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Sycp2Q9CUU3 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Sycp2Q9CUU3 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Sycp2Q9CUU3 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms