Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUH1

4930553M12Rik, RIKEN cDNA 4930553M12 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930553M12RikQ9CUH1 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930553M12RikQ9CUH1 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930553M12RikQ9CUH1 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms