Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTG6

Atp13a2, Cation-transporting ATPase 13A2, mousemouse

Predictions only

Length 1,169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a2Q9CTG6 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp13a2Q9CTG6 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp13a2Q9CTG6 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp13a2Q9CTG6 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp13a2Q9CTG6 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp13a2Q9CTG6 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp13a2Q9CTG6 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp13a2Q9CTG6 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp13a2Q9CTG6 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp13a2Q9CTG6 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp13a2Q9CTG6 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp13a2Q9CTG6 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp13a2Q9CTG6 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp13a2Q9CTG6 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp13a2Q9CTG6 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp13a2Q9CTG6 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp13a2Q9CTG6 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp13a2Q9CTG6 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp13a2Q9CTG6 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp13a2Q9CTG6 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp13a2Q9CTG6 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp13a2Q9CTG6 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp13a2Q9CTG6 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp13a2Q9CTG6 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp13a2Q9CTG6 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp13a2Q9CTG6 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp13a2Q9CTG6 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp13a2Q9CTG6 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp13a2Q9CTG6 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp13a2Q9CTG6 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp13a2Q9CTG6 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp13a2Q9CTG6 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp13a2Q9CTG6 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp13a2Q9CTG6 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp13a2Q9CTG6 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp13a2Q9CTG6 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp13a2Q9CTG6 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp13a2Q9CTG6 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp13a2Q9CTG6 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp13a2Q9CTG6 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp13a2Q9CTG6 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp13a2Q9CTG6 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp13a2Q9CTG6 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp13a2Q9CTG6 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp13a2Q9CTG6 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp13a2Q9CTG6 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp13a2Q9CTG6 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp13a2Q9CTG6 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp13a2Q9CTG6 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp13a2Q9CTG6 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp13a2Q9CTG6 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp13a2Q9CTG6 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp13a2Q9CTG6 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp13a2Q9CTG6 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Atp13a2Q9CTG6 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Atp13a2Q9CTG6 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Atp13a2Q9CTG6 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Atp13a2Q9CTG6 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Atp13a2Q9CTG6 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp13a2Q9CTG6 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp13a2Q9CTG6 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp13a2Q9CTG6 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp13a2Q9CTG6 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp13a2Q9CTG6 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp13a2Q9CTG6 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp13a2Q9CTG6 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp13a2Q9CTG6 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp13a2Q9CTG6 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp13a2Q9CTG6 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp13a2Q9CTG6 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp13a2Q9CTG6 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp13a2Q9CTG6 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp13a2Q9CTG6 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp13a2Q9CTG6 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp13a2Q9CTG6 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp13a2Q9CTG6 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp13a2Q9CTG6 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp13a2Q9CTG6 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp13a2Q9CTG6 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atp13a2Q9CTG6 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atp13a2Q9CTG6 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atp13a2Q9CTG6 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atp13a2Q9CTG6 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atp13a2Q9CTG6 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atp13a2Q9CTG6 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atp13a2Q9CTG6 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atp13a2Q9CTG6 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atp13a2Q9CTG6 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atp13a2Q9CTG6 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atp13a2Q9CTG6 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atp13a2Q9CTG6 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atp13a2Q9CTG6 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atp13a2Q9CTG6 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atp13a2Q9CTG6 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atp13a2Q9CTG6 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Atp13a2Q9CTG6 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atp13a2Q9CTG6 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atp13a2Q9CTG6 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atp13a2Q9CTG6 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atp13a2Q9CTG6 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.9 ms