Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSV6

Sft2d3, Vesicle transport protein SFT2C, mousemouse

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Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d3Q9CSV6 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sft2d3Q9CSV6 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sft2d3Q9CSV6 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sft2d3Q9CSV6 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sft2d3Q9CSV6 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sft2d3Q9CSV6 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sft2d3Q9CSV6 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sft2d3Q9CSV6 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sft2d3Q9CSV6 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sft2d3Q9CSV6 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sft2d3Q9CSV6 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sft2d3Q9CSV6 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Sft2d3Q9CSV6 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sft2d3Q9CSV6 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sft2d3Q9CSV6 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sft2d3Q9CSV6 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Sft2d3Q9CSV6 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Sft2d3Q9CSV6 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sft2d3Q9CSV6 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sft2d3Q9CSV6 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sft2d3Q9CSV6 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sft2d3Q9CSV6 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sft2d3Q9CSV6 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sft2d3Q9CSV6 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sft2d3Q9CSV6 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sft2d3Q9CSV6 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sft2d3Q9CSV6 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sft2d3Q9CSV6 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sft2d3Q9CSV6 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sft2d3Q9CSV6 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sft2d3Q9CSV6 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sft2d3Q9CSV6 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sft2d3Q9CSV6 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sft2d3Q9CSV6 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Sft2d3Q9CSV6 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Sft2d3Q9CSV6 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Sft2d3Q9CSV6 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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