Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snw1Q9CSN1 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snw1Q9CSN1 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snw1Q9CSN1 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snw1Q9CSN1 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snw1Q9CSN1 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snw1Q9CSN1 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snw1Q9CSN1 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snw1Q9CSN1 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snw1Q9CSN1 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snw1Q9CSN1 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Snw1Q9CSN1 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snw1Q9CSN1 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Snw1Q9CSN1 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snw1Q9CSN1 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snw1Q9CSN1 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snw1Q9CSN1 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snw1Q9CSN1 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snw1Q9CSN1 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snw1Q9CSN1 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snw1Q9CSN1 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snw1Q9CSN1 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snw1Q9CSN1 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snw1Q9CSN1 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snw1Q9CSN1 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snw1Q9CSN1 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snw1Q9CSN1 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snw1Q9CSN1 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snw1Q9CSN1 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snw1Q9CSN1 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snw1Q9CSN1 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snw1Q9CSN1 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snw1Q9CSN1 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snw1Q9CSN1 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snw1Q9CSN1 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snw1Q9CSN1 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Snw1Q9CSN1 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Snw1Q9CSN1 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snw1Q9CSN1 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Snw1Q9CSN1 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snw1Q9CSN1 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snw1Q9CSN1 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snw1Q9CSN1 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snw1Q9CSN1 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snw1Q9CSN1 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Snw1Q9CSN1 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snw1Q9CSN1 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Snw1Q9CSN1 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snw1Q9CSN1 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snw1Q9CSN1 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snw1Q9CSN1 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snw1Q9CSN1 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snw1Q9CSN1 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snw1Q9CSN1 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snw1Q9CSN1 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snw1Q9CSN1 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snw1Q9CSN1 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snw1Q9CSN1 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snw1Q9CSN1 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snw1Q9CSN1 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snw1Q9CSN1 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snw1Q9CSN1 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snw1Q9CSN1 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snw1Q9CSN1 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snw1Q9CSN1 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snw1Q9CSN1 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Snw1Q9CSN1 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snw1Q9CSN1 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snw1Q9CSN1 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snw1Q9CSN1 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snw1Q9CSN1 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snw1Q9CSN1 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snw1Q9CSN1 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snw1Q9CSN1 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Snw1Q9CSN1 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snw1Q9CSN1 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snw1Q9CSN1 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Snw1Q9CSN1 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snw1Q9CSN1 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snw1Q9CSN1 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snw1Q9CSN1 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snw1Q9CSN1 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snw1Q9CSN1 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snw1Q9CSN1 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Snw1Q9CSN1 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Snw1Q9CSN1 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snw1Q9CSN1 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snw1Q9CSN1 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Snw1Q9CSN1 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snw1Q9CSN1 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snw1Q9CSN1 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snw1Q9CSN1 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snw1Q9CSN1 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snw1Q9CSN1 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snw1Q9CSN1 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snw1Q9CSN1 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Snw1Q9CSN1 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snw1Q9CSN1 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snw1Q9CSN1 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snw1Q9CSN1 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms