Protein–RNA interactions for Protein: Q9CS84

Nrxn1, Neurexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrxn1Q9CS84 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nrxn1Q9CS84 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nrxn1Q9CS84 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nrxn1Q9CS84 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nrxn1Q9CS84 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nrxn1Q9CS84 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Nrxn1Q9CS84 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nrxn1Q9CS84 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nrxn1Q9CS84 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nrxn1Q9CS84 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nrxn1Q9CS84 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nrxn1Q9CS84 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nrxn1Q9CS84 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nrxn1Q9CS84 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nrxn1Q9CS84 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Nrxn1Q9CS84 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Nrxn1Q9CS84 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Nrxn1Q9CS84 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Nrxn1Q9CS84 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Nrxn1Q9CS84 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Nrxn1Q9CS84 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Nrxn1Q9CS84 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Nrxn1Q9CS84 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Nrxn1Q9CS84 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Nrxn1Q9CS84 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Nrxn1Q9CS84 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Nrxn1Q9CS84 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Nrxn1Q9CS84 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Nrxn1Q9CS84 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Nrxn1Q9CS84 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Nrxn1Q9CS84 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Nrxn1Q9CS84 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nrxn1Q9CS84 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nrxn1Q9CS84 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Nrxn1Q9CS84 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Nrxn1Q9CS84 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nrxn1Q9CS84 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nrxn1Q9CS84 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nrxn1Q9CS84 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nrxn1Q9CS84 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nrxn1Q9CS84 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nrxn1Q9CS84 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nrxn1Q9CS84 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nrxn1Q9CS84 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nrxn1Q9CS84 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nrxn1Q9CS84 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nrxn1Q9CS84 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nrxn1Q9CS84 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nrxn1Q9CS84 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nrxn1Q9CS84 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nrxn1Q9CS84 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nrxn1Q9CS84 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Nrxn1Q9CS84 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nrxn1Q9CS84 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nrxn1Q9CS84 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nrxn1Q9CS84 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nrxn1Q9CS84 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nrxn1Q9CS84 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nrxn1Q9CS84 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nrxn1Q9CS84 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nrxn1Q9CS84 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nrxn1Q9CS84 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nrxn1Q9CS84 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nrxn1Q9CS84 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nrxn1Q9CS84 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nrxn1Q9CS84 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nrxn1Q9CS84 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nrxn1Q9CS84 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nrxn1Q9CS84 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nrxn1Q9CS84 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nrxn1Q9CS84 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nrxn1Q9CS84 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nrxn1Q9CS84 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nrxn1Q9CS84 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nrxn1Q9CS84 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nrxn1Q9CS84 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nrxn1Q9CS84 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nrxn1Q9CS84 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nrxn1Q9CS84 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nrxn1Q9CS84 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nrxn1Q9CS84 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nrxn1Q9CS84 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nrxn1Q9CS84 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nrxn1Q9CS84 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nrxn1Q9CS84 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nrxn1Q9CS84 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nrxn1Q9CS84 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nrxn1Q9CS84 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nrxn1Q9CS84 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nrxn1Q9CS84 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Nrxn1Q9CS84 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nrxn1Q9CS84 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Nrxn1Q9CS84 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nrxn1Q9CS84 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nrxn1Q9CS84 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nrxn1Q9CS84 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nrxn1Q9CS84 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nrxn1Q9CS84 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nrxn1Q9CS84 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nrxn1Q9CS84 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms