Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR55

UPF0547 protein C16orf87 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CR55 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Q9CR55 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9CR55 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9CR55 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9CR55 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9CR55 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q9CR55 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Q9CR55 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Q9CR55 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q9CR55 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q9CR55 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q9CR55 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q9CR55 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Q9CR55 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q9CR55 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q9CR55 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9CR55 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9CR55 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Q9CR55 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9CR55 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9CR55 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Q9CR55 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9CR55 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9CR55 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Q9CR55 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9CR55 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9CR55 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9CR55 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9CR55 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9CR55 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Q9CR55 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9CR55 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9CR55 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Q9CR55 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9CR55 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9CR55 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Q9CR55 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9CR55 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Q9CR55 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Q9CR55 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Q9CR55 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Q9CR55 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Q9CR55 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Q9CR55 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9CR55 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Q9CR55 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Q9CR55 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Q9CR55 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Q9CR55 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9CR55 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9CR55 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Q9CR55 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Q9CR55 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Q9CR55 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9CR55 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9CR55 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9CR55 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9CR55 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9CR55 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9CR55 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9CR55 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9CR55 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9CR55 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9CR55 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9CR55 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9CR55 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9CR55 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9CR55 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9CR55 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9CR55 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Q9CR55 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9CR55 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9CR55 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9CR55 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Q9CR55 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9CR55 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9CR55 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Q9CR55 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Q9CR55 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Q9CR55 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Q9CR55 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Q9CR55 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9CR55 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Q9CR55 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9CR55 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Q9CR55 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9CR55 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9CR55 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9CR55 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9CR55 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9CR55 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9CR55 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9CR55 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Q9CR55 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Q9CR55 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.02■□□□□ -0
Q9CR55 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q9CR55 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q9CR55 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Q9CR55 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Q9CR55 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms