Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQX5

Cldnd1, Claudin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldnd1Q9CQX5 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cldnd1Q9CQX5 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cldnd1Q9CQX5 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cldnd1Q9CQX5 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cldnd1Q9CQX5 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldnd1Q9CQX5 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldnd1Q9CQX5 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldnd1Q9CQX5 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldnd1Q9CQX5 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldnd1Q9CQX5 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldnd1Q9CQX5 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldnd1Q9CQX5 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldnd1Q9CQX5 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldnd1Q9CQX5 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldnd1Q9CQX5 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldnd1Q9CQX5 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldnd1Q9CQX5 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldnd1Q9CQX5 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldnd1Q9CQX5 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldnd1Q9CQX5 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldnd1Q9CQX5 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldnd1Q9CQX5 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldnd1Q9CQX5 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldnd1Q9CQX5 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldnd1Q9CQX5 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldnd1Q9CQX5 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldnd1Q9CQX5 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldnd1Q9CQX5 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldnd1Q9CQX5 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldnd1Q9CQX5 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldnd1Q9CQX5 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldnd1Q9CQX5 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldnd1Q9CQX5 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldnd1Q9CQX5 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldnd1Q9CQX5 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldnd1Q9CQX5 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldnd1Q9CQX5 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldnd1Q9CQX5 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldnd1Q9CQX5 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldnd1Q9CQX5 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldnd1Q9CQX5 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldnd1Q9CQX5 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldnd1Q9CQX5 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldnd1Q9CQX5 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldnd1Q9CQX5 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldnd1Q9CQX5 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldnd1Q9CQX5 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldnd1Q9CQX5 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldnd1Q9CQX5 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldnd1Q9CQX5 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldnd1Q9CQX5 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldnd1Q9CQX5 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldnd1Q9CQX5 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldnd1Q9CQX5 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldnd1Q9CQX5 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldnd1Q9CQX5 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldnd1Q9CQX5 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldnd1Q9CQX5 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldnd1Q9CQX5 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldnd1Q9CQX5 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldnd1Q9CQX5 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldnd1Q9CQX5 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldnd1Q9CQX5 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldnd1Q9CQX5 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldnd1Q9CQX5 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldnd1Q9CQX5 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldnd1Q9CQX5 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldnd1Q9CQX5 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldnd1Q9CQX5 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldnd1Q9CQX5 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldnd1Q9CQX5 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldnd1Q9CQX5 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldnd1Q9CQX5 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldnd1Q9CQX5 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldnd1Q9CQX5 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldnd1Q9CQX5 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldnd1Q9CQX5 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldnd1Q9CQX5 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldnd1Q9CQX5 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldnd1Q9CQX5 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldnd1Q9CQX5 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldnd1Q9CQX5 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldnd1Q9CQX5 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldnd1Q9CQX5 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldnd1Q9CQX5 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldnd1Q9CQX5 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldnd1Q9CQX5 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldnd1Q9CQX5 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldnd1Q9CQX5 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldnd1Q9CQX5 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldnd1Q9CQX5 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldnd1Q9CQX5 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldnd1Q9CQX5 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldnd1Q9CQX5 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldnd1Q9CQX5 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldnd1Q9CQX5 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldnd1Q9CQX5 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldnd1Q9CQX5 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldnd1Q9CQX5 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldnd1Q9CQX5 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms