Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ykt6Q9CQW1 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ykt6Q9CQW1 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ykt6Q9CQW1 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ykt6Q9CQW1 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ykt6Q9CQW1 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Ykt6Q9CQW1 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Ykt6Q9CQW1 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ykt6Q9CQW1 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ykt6Q9CQW1 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ykt6Q9CQW1 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ykt6Q9CQW1 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ykt6Q9CQW1 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ykt6Q9CQW1 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Ykt6Q9CQW1 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ykt6Q9CQW1 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ykt6Q9CQW1 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ykt6Q9CQW1 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ykt6Q9CQW1 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ykt6Q9CQW1 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ykt6Q9CQW1 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ykt6Q9CQW1 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ykt6Q9CQW1 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ykt6Q9CQW1 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ykt6Q9CQW1 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ykt6Q9CQW1 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ykt6Q9CQW1 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ykt6Q9CQW1 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ykt6Q9CQW1 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ykt6Q9CQW1 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ykt6Q9CQW1 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ykt6Q9CQW1 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Ykt6Q9CQW1 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ykt6Q9CQW1 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ykt6Q9CQW1 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ykt6Q9CQW1 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ykt6Q9CQW1 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ykt6Q9CQW1 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ykt6Q9CQW1 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ykt6Q9CQW1 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ykt6Q9CQW1 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ykt6Q9CQW1 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ykt6Q9CQW1 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ykt6Q9CQW1 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ykt6Q9CQW1 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ykt6Q9CQW1 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ykt6Q9CQW1 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ykt6Q9CQW1 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ykt6Q9CQW1 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ykt6Q9CQW1 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Ykt6Q9CQW1 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Ykt6Q9CQW1 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ykt6Q9CQW1 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Ykt6Q9CQW1 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ykt6Q9CQW1 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ykt6Q9CQW1 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ykt6Q9CQW1 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ykt6Q9CQW1 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ykt6Q9CQW1 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ykt6Q9CQW1 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ykt6Q9CQW1 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ykt6Q9CQW1 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ykt6Q9CQW1 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ykt6Q9CQW1 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ykt6Q9CQW1 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ykt6Q9CQW1 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ykt6Q9CQW1 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ykt6Q9CQW1 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ykt6Q9CQW1 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ykt6Q9CQW1 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ykt6Q9CQW1 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ykt6Q9CQW1 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ykt6Q9CQW1 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ykt6Q9CQW1 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ykt6Q9CQW1 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ykt6Q9CQW1 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ykt6Q9CQW1 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ykt6Q9CQW1 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ykt6Q9CQW1 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ykt6Q9CQW1 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Ykt6Q9CQW1 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ykt6Q9CQW1 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ykt6Q9CQW1 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ykt6Q9CQW1 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Ykt6Q9CQW1 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ykt6Q9CQW1 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Ykt6Q9CQW1 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ykt6Q9CQW1 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ykt6Q9CQW1 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ykt6Q9CQW1 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ykt6Q9CQW1 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ykt6Q9CQW1 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ykt6Q9CQW1 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ykt6Q9CQW1 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ykt6Q9CQW1 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ykt6Q9CQW1 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ykt6Q9CQW1 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ykt6Q9CQW1 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ykt6Q9CQW1 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ykt6Q9CQW1 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms