Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ7

Atp5f1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5f1Q9CQQ7 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Atp5f1Q9CQQ7 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Atp5f1Q9CQQ7 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Atp5f1Q9CQQ7 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Atp5f1Q9CQQ7 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atp5f1Q9CQQ7 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
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Atp5f1Q9CQQ7 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atp5f1Q9CQQ7 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Atp5f1Q9CQQ7 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Atp5f1Q9CQQ7 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Atp5f1Q9CQQ7 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atp5f1Q9CQQ7 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Atp5f1Q9CQQ7 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atp5f1Q9CQQ7 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atp5f1Q9CQQ7 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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