Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Smim8Q9CQQ0 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smim8Q9CQQ0 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smim8Q9CQQ0 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smim8Q9CQQ0 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smim8Q9CQQ0 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smim8Q9CQQ0 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smim8Q9CQQ0 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Smim8Q9CQQ0 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smim8Q9CQQ0 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smim8Q9CQQ0 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smim8Q9CQQ0 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smim8Q9CQQ0 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smim8Q9CQQ0 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smim8Q9CQQ0 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smim8Q9CQQ0 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smim8Q9CQQ0 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smim8Q9CQQ0 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smim8Q9CQQ0 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smim8Q9CQQ0 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smim8Q9CQQ0 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smim8Q9CQQ0 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smim8Q9CQQ0 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smim8Q9CQQ0 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim8Q9CQQ0 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim8Q9CQQ0 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim8Q9CQQ0 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim8Q9CQQ0 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim8Q9CQQ0 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim8Q9CQQ0 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim8Q9CQQ0 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim8Q9CQQ0 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim8Q9CQQ0 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim8Q9CQQ0 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim8Q9CQQ0 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim8Q9CQQ0 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim8Q9CQQ0 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim8Q9CQQ0 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim8Q9CQQ0 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim8Q9CQQ0 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim8Q9CQQ0 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim8Q9CQQ0 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim8Q9CQQ0 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim8Q9CQQ0 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim8Q9CQQ0 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim8Q9CQQ0 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim8Q9CQQ0 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim8Q9CQQ0 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim8Q9CQQ0 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms