Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL6

Mrpl35, 39S ribosomal protein L35, mitochondrial, mousemouse

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl35Q9CQL6 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Mrpl35Q9CQL6 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Mrpl35Q9CQL6 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Mrpl35Q9CQL6 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Mrpl35Q9CQL6 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Mrpl35Q9CQL6 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mrpl35Q9CQL6 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mrpl35Q9CQL6 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Mrpl35Q9CQL6 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mrpl35Q9CQL6 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mrpl35Q9CQL6 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mrpl35Q9CQL6 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mrpl35Q9CQL6 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mrpl35Q9CQL6 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mrpl35Q9CQL6 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mrpl35Q9CQL6 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Mrpl35Q9CQL6 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mrpl35Q9CQL6 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mrpl35Q9CQL6 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mrpl35Q9CQL6 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mrpl35Q9CQL6 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mrpl35Q9CQL6 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mrpl35Q9CQL6 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mrpl35Q9CQL6 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mrpl35Q9CQL6 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Mrpl35Q9CQL6 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Mrpl35Q9CQL6 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Mrpl35Q9CQL6 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Mrpl35Q9CQL6 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mrpl35Q9CQL6 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mrpl35Q9CQL6 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mrpl35Q9CQL6 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mrpl35Q9CQL6 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mrpl35Q9CQL6 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mrpl35Q9CQL6 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mrpl35Q9CQL6 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Mrpl35Q9CQL6 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mrpl35Q9CQL6 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mrpl35Q9CQL6 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Mrpl35Q9CQL6 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Mrpl35Q9CQL6 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mrpl35Q9CQL6 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Mrpl35Q9CQL6 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mrpl35Q9CQL6 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Mrpl35Q9CQL6 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Mrpl35Q9CQL6 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Mrpl35Q9CQL6 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Mrpl35Q9CQL6 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mrpl35Q9CQL6 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mrpl35Q9CQL6 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mrpl35Q9CQL6 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Mrpl35Q9CQL6 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Mrpl35Q9CQL6 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Mrpl35Q9CQL6 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mrpl35Q9CQL6 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mrpl35Q9CQL6 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mrpl35Q9CQL6 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mrpl35Q9CQL6 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mrpl35Q9CQL6 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mrpl35Q9CQL6 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Mrpl35Q9CQL6 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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