Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ8

Ndufb9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb9Q9CQJ8 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ndufb9Q9CQJ8 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ndufb9Q9CQJ8 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ndufb9Q9CQJ8 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ndufb9Q9CQJ8 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ndufb9Q9CQJ8 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ndufb9Q9CQJ8 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ndufb9Q9CQJ8 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ndufb9Q9CQJ8 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ndufb9Q9CQJ8 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ndufb9Q9CQJ8 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ndufb9Q9CQJ8 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ndufb9Q9CQJ8 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ndufb9Q9CQJ8 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ndufb9Q9CQJ8 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ndufb9Q9CQJ8 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ndufb9Q9CQJ8 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ndufb9Q9CQJ8 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ndufb9Q9CQJ8 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ndufb9Q9CQJ8 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ndufb9Q9CQJ8 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ndufb9Q9CQJ8 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ndufb9Q9CQJ8 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ndufb9Q9CQJ8 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ndufb9Q9CQJ8 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ndufb9Q9CQJ8 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ndufb9Q9CQJ8 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ndufb9Q9CQJ8 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ndufb9Q9CQJ8 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ndufb9Q9CQJ8 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ndufb9Q9CQJ8 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ndufb9Q9CQJ8 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ndufb9Q9CQJ8 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ndufb9Q9CQJ8 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ndufb9Q9CQJ8 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ndufb9Q9CQJ8 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ndufb9Q9CQJ8 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ndufb9Q9CQJ8 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ndufb9Q9CQJ8 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ndufb9Q9CQJ8 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ndufb9Q9CQJ8 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ndufb9Q9CQJ8 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ndufb9Q9CQJ8 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ndufb9Q9CQJ8 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ndufb9Q9CQJ8 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ndufb9Q9CQJ8 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ndufb9Q9CQJ8 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ndufb9Q9CQJ8 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ndufb9Q9CQJ8 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ndufb9Q9CQJ8 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ndufb9Q9CQJ8 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ndufb9Q9CQJ8 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ndufb9Q9CQJ8 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ndufb9Q9CQJ8 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ndufb9Q9CQJ8 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ndufb9Q9CQJ8 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ndufb9Q9CQJ8 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ndufb9Q9CQJ8 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ndufb9Q9CQJ8 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ndufb9Q9CQJ8 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ndufb9Q9CQJ8 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ndufb9Q9CQJ8 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ndufb9Q9CQJ8 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ndufb9Q9CQJ8 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ndufb9Q9CQJ8 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ndufb9Q9CQJ8 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ndufb9Q9CQJ8 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ndufb9Q9CQJ8 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ndufb9Q9CQJ8 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ndufb9Q9CQJ8 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ndufb9Q9CQJ8 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ndufb9Q9CQJ8 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ndufb9Q9CQJ8 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ndufb9Q9CQJ8 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ndufb9Q9CQJ8 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ndufb9Q9CQJ8 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ndufb9Q9CQJ8 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ndufb9Q9CQJ8 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ndufb9Q9CQJ8 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ndufb9Q9CQJ8 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ndufb9Q9CQJ8 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ndufb9Q9CQJ8 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ndufb9Q9CQJ8 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ndufb9Q9CQJ8 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ndufb9Q9CQJ8 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ndufb9Q9CQJ8 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ndufb9Q9CQJ8 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ndufb9Q9CQJ8 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ndufb9Q9CQJ8 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ndufb9Q9CQJ8 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ndufb9Q9CQJ8 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ndufb9Q9CQJ8 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ndufb9Q9CQJ8 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ndufb9Q9CQJ8 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ndufb9Q9CQJ8 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ndufb9Q9CQJ8 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ndufb9Q9CQJ8 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ndufb9Q9CQJ8 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ndufb9Q9CQJ8 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ndufb9Q9CQJ8 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms