Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ1

Higd2a, HIG1 domain family member 2A, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd2aQ9CQJ1 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Higd2aQ9CQJ1 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms