Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pdzk1ip1Q9CQH0 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pdzk1ip1Q9CQH0 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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