Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Atp6v0e1Q9CQD8 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Atp6v0e1Q9CQD8 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Atp6v0e1Q9CQD8 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Atp6v0e1Q9CQD8 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Atp6v0e1Q9CQD8 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Atp6v0e1Q9CQD8 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Atp6v0e1Q9CQD8 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Atp6v0e1Q9CQD8 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Atp6v0e1Q9CQD8 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Atp6v0e1Q9CQD8 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Atp6v0e1Q9CQD8 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Atp6v0e1Q9CQD8 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Atp6v0e1Q9CQD8 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Atp6v0e1Q9CQD8 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Atp6v0e1Q9CQD8 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Atp6v0e1Q9CQD8 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Atp6v0e1Q9CQD8 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Atp6v0e1Q9CQD8 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Atp6v0e1Q9CQD8 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Atp6v0e1Q9CQD8 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Atp6v0e1Q9CQD8 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Atp6v0e1Q9CQD8 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Atp6v0e1Q9CQD8 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Atp6v0e1Q9CQD8 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Atp6v0e1Q9CQD8 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Atp6v0e1Q9CQD8 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Atp6v0e1Q9CQD8 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Atp6v0e1Q9CQD8 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Atp6v0e1Q9CQD8 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Atp6v0e1Q9CQD8 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Atp6v0e1Q9CQD8 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Atp6v0e1Q9CQD8 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Atp6v0e1Q9CQD8 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atp6v0e1Q9CQD8 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atp6v0e1Q9CQD8 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atp6v0e1Q9CQD8 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atp6v0e1Q9CQD8 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atp6v0e1Q9CQD8 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atp6v0e1Q9CQD8 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atp6v0e1Q9CQD8 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atp6v0e1Q9CQD8 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Atp6v0e1Q9CQD8 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atp6v0e1Q9CQD8 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atp6v0e1Q9CQD8 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Atp6v0e1Q9CQD8 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atp6v0e1Q9CQD8 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atp6v0e1Q9CQD8 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atp6v0e1Q9CQD8 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atp6v0e1Q9CQD8 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atp6v0e1Q9CQD8 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atp6v0e1Q9CQD8 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atp6v0e1Q9CQD8 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atp6v0e1Q9CQD8 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atp6v0e1Q9CQD8 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atp6v0e1Q9CQD8 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atp6v0e1Q9CQD8 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atp6v0e1Q9CQD8 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atp6v0e1Q9CQD8 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atp6v0e1Q9CQD8 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atp6v0e1Q9CQD8 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atp6v0e1Q9CQD8 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atp6v0e1Q9CQD8 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atp6v0e1Q9CQD8 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atp6v0e1Q9CQD8 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atp6v0e1Q9CQD8 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atp6v0e1Q9CQD8 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atp6v0e1Q9CQD8 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atp6v0e1Q9CQD8 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atp6v0e1Q9CQD8 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atp6v0e1Q9CQD8 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atp6v0e1Q9CQD8 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atp6v0e1Q9CQD8 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atp6v0e1Q9CQD8 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atp6v0e1Q9CQD8 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Atp6v0e1Q9CQD8 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atp6v0e1Q9CQD8 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atp6v0e1Q9CQD8 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atp6v0e1Q9CQD8 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atp6v0e1Q9CQD8 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atp6v0e1Q9CQD8 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atp6v0e1Q9CQD8 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atp6v0e1Q9CQD8 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atp6v0e1Q9CQD8 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atp6v0e1Q9CQD8 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atp6v0e1Q9CQD8 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atp6v0e1Q9CQD8 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atp6v0e1Q9CQD8 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atp6v0e1Q9CQD8 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atp6v0e1Q9CQD8 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Atp6v0e1Q9CQD8 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
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