Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Atg3Q9CPX6 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Atg3Q9CPX6 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atg3Q9CPX6 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atg3Q9CPX6 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atg3Q9CPX6 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atg3Q9CPX6 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Atg3Q9CPX6 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atg3Q9CPX6 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atg3Q9CPX6 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atg3Q9CPX6 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atg3Q9CPX6 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atg3Q9CPX6 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atg3Q9CPX6 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atg3Q9CPX6 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atg3Q9CPX6 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atg3Q9CPX6 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atg3Q9CPX6 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atg3Q9CPX6 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atg3Q9CPX6 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atg3Q9CPX6 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atg3Q9CPX6 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atg3Q9CPX6 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atg3Q9CPX6 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atg3Q9CPX6 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Atg3Q9CPX6 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atg3Q9CPX6 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atg3Q9CPX6 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Atg3Q9CPX6 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atg3Q9CPX6 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atg3Q9CPX6 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atg3Q9CPX6 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atg3Q9CPX6 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atg3Q9CPX6 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atg3Q9CPX6 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atg3Q9CPX6 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atg3Q9CPX6 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atg3Q9CPX6 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atg3Q9CPX6 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atg3Q9CPX6 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atg3Q9CPX6 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atg3Q9CPX6 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Atg3Q9CPX6 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atg3Q9CPX6 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atg3Q9CPX6 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atg3Q9CPX6 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Atg3Q9CPX6 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atg3Q9CPX6 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Atg3Q9CPX6 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atg3Q9CPX6 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atg3Q9CPX6 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atg3Q9CPX6 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atg3Q9CPX6 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atg3Q9CPX6 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atg3Q9CPX6 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atg3Q9CPX6 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atg3Q9CPX6 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atg3Q9CPX6 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atg3Q9CPX6 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atg3Q9CPX6 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atg3Q9CPX6 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atg3Q9CPX6 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atg3Q9CPX6 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atg3Q9CPX6 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atg3Q9CPX6 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atg3Q9CPX6 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Atg3Q9CPX6 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atg3Q9CPX6 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Atg3Q9CPX6 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Atg3Q9CPX6 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Atg3Q9CPX6 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Atg3Q9CPX6 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Atg3Q9CPX6 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atg3Q9CPX6 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Atg3Q9CPX6 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Atg3Q9CPX6 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Atg3Q9CPX6 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Atg3Q9CPX6 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Atg3Q9CPX6 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Atg3Q9CPX6 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Atg3Q9CPX6 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Atg3Q9CPX6 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Atg3Q9CPX6 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atg3Q9CPX6 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atg3Q9CPX6 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atg3Q9CPX6 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Atg3Q9CPX6 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Atg3Q9CPX6 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atg3Q9CPX6 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atg3Q9CPX6 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atg3Q9CPX6 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atg3Q9CPX6 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atg3Q9CPX6 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atg3Q9CPX6 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atg3Q9CPX6 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atg3Q9CPX6 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atg3Q9CPX6 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Atg3Q9CPX6 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atg3Q9CPX6 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atg3Q9CPX6 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms