Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPU1

Ssxb1, MCG116417, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb1Q9CPU1 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssxb1Q9CPU1 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssxb1Q9CPU1 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssxb1Q9CPU1 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssxb1Q9CPU1 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssxb1Q9CPU1 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssxb1Q9CPU1 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssxb1Q9CPU1 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssxb1Q9CPU1 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssxb1Q9CPU1 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssxb1Q9CPU1 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssxb1Q9CPU1 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssxb1Q9CPU1 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssxb1Q9CPU1 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssxb1Q9CPU1 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssxb1Q9CPU1 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssxb1Q9CPU1 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssxb1Q9CPU1 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssxb1Q9CPU1 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssxb1Q9CPU1 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssxb1Q9CPU1 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssxb1Q9CPU1 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssxb1Q9CPU1 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssxb1Q9CPU1 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssxb1Q9CPU1 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssxb1Q9CPU1 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssxb1Q9CPU1 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssxb1Q9CPU1 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssxb1Q9CPU1 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssxb1Q9CPU1 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssxb1Q9CPU1 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssxb1Q9CPU1 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssxb1Q9CPU1 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssxb1Q9CPU1 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssxb1Q9CPU1 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssxb1Q9CPU1 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssxb1Q9CPU1 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssxb1Q9CPU1 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssxb1Q9CPU1 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssxb1Q9CPU1 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssxb1Q9CPU1 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssxb1Q9CPU1 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssxb1Q9CPU1 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssxb1Q9CPU1 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssxb1Q9CPU1 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssxb1Q9CPU1 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssxb1Q9CPU1 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssxb1Q9CPU1 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssxb1Q9CPU1 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssxb1Q9CPU1 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssxb1Q9CPU1 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssxb1Q9CPU1 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssxb1Q9CPU1 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssxb1Q9CPU1 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssxb1Q9CPU1 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssxb1Q9CPU1 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssxb1Q9CPU1 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssxb1Q9CPU1 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssxb1Q9CPU1 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssxb1Q9CPU1 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssxb1Q9CPU1 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssxb1Q9CPU1 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssxb1Q9CPU1 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssxb1Q9CPU1 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssxb1Q9CPU1 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssxb1Q9CPU1 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssxb1Q9CPU1 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssxb1Q9CPU1 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssxb1Q9CPU1 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssxb1Q9CPU1 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssxb1Q9CPU1 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssxb1Q9CPU1 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssxb1Q9CPU1 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssxb1Q9CPU1 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssxb1Q9CPU1 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssxb1Q9CPU1 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssxb1Q9CPU1 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssxb1Q9CPU1 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssxb1Q9CPU1 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssxb1Q9CPU1 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssxb1Q9CPU1 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssxb1Q9CPU1 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssxb1Q9CPU1 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssxb1Q9CPU1 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssxb1Q9CPU1 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssxb1Q9CPU1 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssxb1Q9CPU1 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssxb1Q9CPU1 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssxb1Q9CPU1 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssxb1Q9CPU1 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssxb1Q9CPU1 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssxb1Q9CPU1 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssxb1Q9CPU1 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssxb1Q9CPU1 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssxb1Q9CPU1 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssxb1Q9CPU1 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssxb1Q9CPU1 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssxb1Q9CPU1 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssxb1Q9CPU1 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssxb1Q9CPU1 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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