Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR4

Rpl17, 60S ribosomal protein L17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl17Q9CPR4 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rpl17Q9CPR4 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rpl17Q9CPR4 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rpl17Q9CPR4 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rpl17Q9CPR4 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rpl17Q9CPR4 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rpl17Q9CPR4 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rpl17Q9CPR4 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rpl17Q9CPR4 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rpl17Q9CPR4 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rpl17Q9CPR4 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl17Q9CPR4 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl17Q9CPR4 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl17Q9CPR4 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl17Q9CPR4 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl17Q9CPR4 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl17Q9CPR4 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl17Q9CPR4 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl17Q9CPR4 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl17Q9CPR4 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl17Q9CPR4 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl17Q9CPR4 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl17Q9CPR4 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl17Q9CPR4 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl17Q9CPR4 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl17Q9CPR4 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms