Protein–RNA interactions for Protein: Q99NH8

Trem2, Triggering receptor expressed on myeloid cells 2, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem2Q99NH8 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trem2Q99NH8 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trem2Q99NH8 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trem2Q99NH8 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trem2Q99NH8 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trem2Q99NH8 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trem2Q99NH8 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trem2Q99NH8 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trem2Q99NH8 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trem2Q99NH8 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trem2Q99NH8 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trem2Q99NH8 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trem2Q99NH8 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trem2Q99NH8 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Trem2Q99NH8 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trem2Q99NH8 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trem2Q99NH8 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trem2Q99NH8 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trem2Q99NH8 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Trem2Q99NH8 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trem2Q99NH8 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trem2Q99NH8 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trem2Q99NH8 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trem2Q99NH8 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trem2Q99NH8 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trem2Q99NH8 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trem2Q99NH8 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trem2Q99NH8 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trem2Q99NH8 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trem2Q99NH8 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trem2Q99NH8 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trem2Q99NH8 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trem2Q99NH8 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trem2Q99NH8 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trem2Q99NH8 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trem2Q99NH8 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trem2Q99NH8 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trem2Q99NH8 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trem2Q99NH8 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trem2Q99NH8 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trem2Q99NH8 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trem2Q99NH8 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trem2Q99NH8 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trem2Q99NH8 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trem2Q99NH8 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trem2Q99NH8 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Trem2Q99NH8 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trem2Q99NH8 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trem2Q99NH8 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trem2Q99NH8 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trem2Q99NH8 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trem2Q99NH8 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Trem2Q99NH8 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Trem2Q99NH8 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trem2Q99NH8 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trem2Q99NH8 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trem2Q99NH8 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trem2Q99NH8 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trem2Q99NH8 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trem2Q99NH8 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trem2Q99NH8 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trem2Q99NH8 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trem2Q99NH8 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trem2Q99NH8 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trem2Q99NH8 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trem2Q99NH8 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trem2Q99NH8 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trem2Q99NH8 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trem2Q99NH8 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trem2Q99NH8 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trem2Q99NH8 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trem2Q99NH8 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trem2Q99NH8 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trem2Q99NH8 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trem2Q99NH8 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trem2Q99NH8 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trem2Q99NH8 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trem2Q99NH8 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trem2Q99NH8 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trem2Q99NH8 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Trem2Q99NH8 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trem2Q99NH8 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trem2Q99NH8 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trem2Q99NH8 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trem2Q99NH8 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trem2Q99NH8 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trem2Q99NH8 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trem2Q99NH8 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trem2Q99NH8 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trem2Q99NH8 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Trem2Q99NH8 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trem2Q99NH8 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trem2Q99NH8 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trem2Q99NH8 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trem2Q99NH8 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trem2Q99NH8 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trem2Q99NH8 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trem2Q99NH8 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trem2Q99NH8 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trem2Q99NH8 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms