Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB9

Sf3b1, Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b1Q99NB9 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sf3b1Q99NB9 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sf3b1Q99NB9 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sf3b1Q99NB9 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sf3b1Q99NB9 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sf3b1Q99NB9 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sf3b1Q99NB9 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sf3b1Q99NB9 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sf3b1Q99NB9 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sf3b1Q99NB9 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sf3b1Q99NB9 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sf3b1Q99NB9 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sf3b1Q99NB9 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Sf3b1Q99NB9 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sf3b1Q99NB9 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sf3b1Q99NB9 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sf3b1Q99NB9 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sf3b1Q99NB9 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Sf3b1Q99NB9 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sf3b1Q99NB9 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sf3b1Q99NB9 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sf3b1Q99NB9 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sf3b1Q99NB9 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sf3b1Q99NB9 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sf3b1Q99NB9 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sf3b1Q99NB9 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sf3b1Q99NB9 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sf3b1Q99NB9 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sf3b1Q99NB9 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sf3b1Q99NB9 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sf3b1Q99NB9 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sf3b1Q99NB9 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sf3b1Q99NB9 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sf3b1Q99NB9 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sf3b1Q99NB9 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sf3b1Q99NB9 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Sf3b1Q99NB9 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Sf3b1Q99NB9 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Sf3b1Q99NB9 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Sf3b1Q99NB9 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sf3b1Q99NB9 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sf3b1Q99NB9 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Sf3b1Q99NB9 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sf3b1Q99NB9 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sf3b1Q99NB9 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sf3b1Q99NB9 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sf3b1Q99NB9 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Sf3b1Q99NB9 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sf3b1Q99NB9 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sf3b1Q99NB9 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sf3b1Q99NB9 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sf3b1Q99NB9 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sf3b1Q99NB9 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sf3b1Q99NB9 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sf3b1Q99NB9 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sf3b1Q99NB9 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sf3b1Q99NB9 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sf3b1Q99NB9 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sf3b1Q99NB9 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sf3b1Q99NB9 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sf3b1Q99NB9 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Sf3b1Q99NB9 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sf3b1Q99NB9 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sf3b1Q99NB9 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sf3b1Q99NB9 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sf3b1Q99NB9 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sf3b1Q99NB9 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sf3b1Q99NB9 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sf3b1Q99NB9 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sf3b1Q99NB9 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sf3b1Q99NB9 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sf3b1Q99NB9 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sf3b1Q99NB9 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sf3b1Q99NB9 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sf3b1Q99NB9 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sf3b1Q99NB9 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sf3b1Q99NB9 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sf3b1Q99NB9 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sf3b1Q99NB9 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sf3b1Q99NB9 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sf3b1Q99NB9 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sf3b1Q99NB9 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sf3b1Q99NB9 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sf3b1Q99NB9 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sf3b1Q99NB9 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sf3b1Q99NB9 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sf3b1Q99NB9 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Sf3b1Q99NB9 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sf3b1Q99NB9 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sf3b1Q99NB9 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sf3b1Q99NB9 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sf3b1Q99NB9 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sf3b1Q99NB9 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sf3b1Q99NB9 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sf3b1Q99NB9 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sf3b1Q99NB9 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sf3b1Q99NB9 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sf3b1Q99NB9 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sf3b1Q99NB9 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sf3b1Q99NB9 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms