Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hdac9Q99N13 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hdac9Q99N13 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hdac9Q99N13 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Hdac9Q99N13 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Hdac9Q99N13 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hdac9Q99N13 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hdac9Q99N13 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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Hdac9Q99N13 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hdac9Q99N13 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hdac9Q99N13 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hdac9Q99N13 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hdac9Q99N13 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hdac9Q99N13 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hdac9Q99N13 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hdac9Q99N13 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hdac9Q99N13 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hdac9Q99N13 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hdac9Q99N13 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hdac9Q99N13 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hdac9Q99N13 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hdac9Q99N13 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hdac9Q99N13 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hdac9Q99N13 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hdac9Q99N13 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hdac9Q99N13 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hdac9Q99N13 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hdac9Q99N13 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hdac9Q99N13 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hdac9Q99N13 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hdac9Q99N13 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hdac9Q99N13 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hdac9Q99N13 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hdac9Q99N13 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hdac9Q99N13 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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Hdac9Q99N13 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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Hdac9Q99N13 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hdac9Q99N13 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hdac9Q99N13 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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Hdac9Q99N13 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hdac9Q99N13 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hdac9Q99N13 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hdac9Q99N13 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hdac9Q99N13 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hdac9Q99N13 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hdac9Q99N13 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hdac9Q99N13 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hdac9Q99N13 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hdac9Q99N13 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hdac9Q99N13 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hdac9Q99N13 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hdac9Q99N13 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hdac9Q99N13 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hdac9Q99N13 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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Hdac9Q99N13 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hdac9Q99N13 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hdac9Q99N13 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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Hdac9Q99N13 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hdac9Q99N13 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hdac9Q99N13 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hdac9Q99N13 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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Hdac9Q99N13 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hdac9Q99N13 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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Hdac9Q99N13 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hdac9Q99N13 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hdac9Q99N13 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hdac9Q99N13 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hdac9Q99N13 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hdac9Q99N13 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hdac9Q99N13 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hdac9Q99N13 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hdac9Q99N13 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hdac9Q99N13 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Hdac9Q99N13 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hdac9Q99N13 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Hdac9Q99N13 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hdac9Q99N13 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Hdac9Q99N13 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hdac9Q99N13 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hdac9Q99N13 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hdac9Q99N13 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hdac9Q99N13 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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