Protein–RNA interactions for Protein: Q99N10

Ms4a8, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 8, mousemouse

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a8Q99N10 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ms4a8Q99N10 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ms4a8Q99N10 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ms4a8Q99N10 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ms4a8Q99N10 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ms4a8Q99N10 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ms4a8Q99N10 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ms4a8Q99N10 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Ms4a8Q99N10 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Ms4a8Q99N10 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ms4a8Q99N10 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ms4a8Q99N10 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ms4a8Q99N10 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ms4a8Q99N10 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ms4a8Q99N10 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ms4a8Q99N10 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ms4a8Q99N10 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ms4a8Q99N10 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ms4a8Q99N10 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ms4a8Q99N10 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ms4a8Q99N10 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ms4a8Q99N10 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ms4a8Q99N10 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ms4a8Q99N10 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ms4a8Q99N10 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ms4a8Q99N10 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ms4a8Q99N10 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ms4a8Q99N10 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ms4a8Q99N10 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ms4a8Q99N10 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ms4a8Q99N10 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ms4a8Q99N10 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ms4a8Q99N10 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ms4a8Q99N10 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ms4a8Q99N10 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ms4a8Q99N10 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ms4a8Q99N10 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ms4a8Q99N10 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ms4a8Q99N10 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ms4a8Q99N10 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ms4a8Q99N10 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ms4a8Q99N10 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ms4a8Q99N10 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ms4a8Q99N10 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ms4a8Q99N10 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ms4a8Q99N10 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ms4a8Q99N10 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ms4a8Q99N10 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ms4a8Q99N10 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ms4a8Q99N10 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ms4a8Q99N10 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ms4a8Q99N10 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ms4a8Q99N10 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ms4a8Q99N10 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ms4a8Q99N10 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ms4a8Q99N10 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ms4a8Q99N10 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ms4a8Q99N10 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ms4a8Q99N10 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ms4a8Q99N10 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ms4a8Q99N10 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ms4a8Q99N10 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ms4a8Q99N10 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ms4a8Q99N10 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ms4a8Q99N10 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ms4a8Q99N10 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ms4a8Q99N10 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ms4a8Q99N10 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ms4a8Q99N10 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ms4a8Q99N10 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ms4a8Q99N10 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ms4a8Q99N10 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ms4a8Q99N10 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ms4a8Q99N10 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ms4a8Q99N10 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ms4a8Q99N10 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ms4a8Q99N10 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ms4a8Q99N10 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ms4a8Q99N10 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ms4a8Q99N10 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ms4a8Q99N10 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ms4a8Q99N10 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ms4a8Q99N10 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ms4a8Q99N10 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ms4a8Q99N10 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ms4a8Q99N10 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ms4a8Q99N10 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ms4a8Q99N10 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ms4a8Q99N10 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ms4a8Q99N10 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ms4a8Q99N10 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ms4a8Q99N10 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ms4a8Q99N10 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ms4a8Q99N10 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ms4a8Q99N10 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ms4a8Q99N10 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ms4a8Q99N10 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ms4a8Q99N10 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ms4a8Q99N10 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ms4a8Q99N10 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms