Protein–RNA interactions for Protein: Q99MW3

Pramel1, Preferentially expressed antigen in melanoma-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel1Q99MW3 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pramel1Q99MW3 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pramel1Q99MW3 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pramel1Q99MW3 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pramel1Q99MW3 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pramel1Q99MW3 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pramel1Q99MW3 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pramel1Q99MW3 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pramel1Q99MW3 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pramel1Q99MW3 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Pramel1Q99MW3 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pramel1Q99MW3 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pramel1Q99MW3 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pramel1Q99MW3 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pramel1Q99MW3 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pramel1Q99MW3 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pramel1Q99MW3 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pramel1Q99MW3 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pramel1Q99MW3 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pramel1Q99MW3 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pramel1Q99MW3 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pramel1Q99MW3 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pramel1Q99MW3 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pramel1Q99MW3 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pramel1Q99MW3 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pramel1Q99MW3 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pramel1Q99MW3 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pramel1Q99MW3 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Pramel1Q99MW3 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pramel1Q99MW3 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pramel1Q99MW3 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pramel1Q99MW3 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pramel1Q99MW3 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pramel1Q99MW3 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pramel1Q99MW3 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pramel1Q99MW3 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pramel1Q99MW3 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pramel1Q99MW3 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pramel1Q99MW3 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pramel1Q99MW3 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pramel1Q99MW3 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pramel1Q99MW3 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pramel1Q99MW3 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pramel1Q99MW3 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pramel1Q99MW3 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pramel1Q99MW3 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pramel1Q99MW3 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pramel1Q99MW3 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pramel1Q99MW3 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pramel1Q99MW3 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pramel1Q99MW3 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pramel1Q99MW3 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pramel1Q99MW3 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pramel1Q99MW3 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pramel1Q99MW3 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Pramel1Q99MW3 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Pramel1Q99MW3 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pramel1Q99MW3 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pramel1Q99MW3 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pramel1Q99MW3 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Pramel1Q99MW3 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pramel1Q99MW3 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Pramel1Q99MW3 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Pramel1Q99MW3 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pramel1Q99MW3 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pramel1Q99MW3 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pramel1Q99MW3 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pramel1Q99MW3 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Pramel1Q99MW3 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pramel1Q99MW3 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pramel1Q99MW3 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pramel1Q99MW3 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pramel1Q99MW3 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pramel1Q99MW3 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pramel1Q99MW3 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pramel1Q99MW3 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pramel1Q99MW3 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pramel1Q99MW3 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pramel1Q99MW3 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pramel1Q99MW3 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pramel1Q99MW3 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pramel1Q99MW3 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pramel1Q99MW3 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pramel1Q99MW3 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pramel1Q99MW3 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pramel1Q99MW3 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pramel1Q99MW3 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pramel1Q99MW3 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pramel1Q99MW3 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pramel1Q99MW3 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Pramel1Q99MW3 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pramel1Q99MW3 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pramel1Q99MW3 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Pramel1Q99MW3 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pramel1Q99MW3 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pramel1Q99MW3 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pramel1Q99MW3 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pramel1Q99MW3 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pramel1Q99MW3 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pramel1Q99MW3 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms